بررسي بيان افتراقي پروتئين هاي محافظ در گياه آرابيدوپسيس تحت تنش شوري با روش iTRAQ-2DLC-MS/MS و آناليز شبكه ژني مربوطه

شناسايي و كميتسنجي پروتئينها و ژنهاي بيان شده در شرايط تنش شوري ميتواند منجر به درك هرچه بهتر مكانيسمهاي پاسخي شود. بدين منظور در اين تحقيق از روش پروتئوميكس مقايسهاي iTRAQ جهت بررسي تغييرات پروتئيني در شرايط تنش شوري و كميتسنجي آنها استفاده شد. سپس جهت بررسيهاي بيشتر پيرامون عملكرد ژنهاي شناسايي شده از اطلاعات بيان ژن و همبياني در پايگاهداده و آناليز توالي هاي مربوطه استفاده شد. با توجه به نتايج به دست آمده از iTRAQ-2DLC-MS/MS مجموعهاي از پروتئينها از جمله P5CS1، KIN1، KIN2، ERD10، ERD14 و COR47 شناسايي شد. نتايج بيان ژنهاي مربوطه نشان داد كه بيان اين ژنها تنها به تنش شوري محدود نميشود و در پاسخ به ساير تنشهاي اسمزي نيز دخالت دارند. شبكهي ژني پروتئينهاي شناسايي شده با نرمافزار String بررسي گرديد. بر اساس نتايج به دست آمده در طي بيان اين ژنها تركيبات محافظ از جمله مواد محلول سازگار، پروتئين هاي دهايدرين و غيره در سلول توليد ميشود كه حضور آنها منجر به القاي مكانيسمهاي مقاومت و تحمل در گياه در برابر تنشهاي اسمزي از جمله شوري مي شود.