بررسي فيوژن ژن اپسيلون - آلفا كلستريديوم پرفرينجنز تيپ D و كلستريديوم سپتيكوم به روش In silico

In silico fusion of epsilon and alpha toxin genes of Clostridium perfringens type D and Clostridium septicum

تكنولوژي DNA نوتركيب يك تكنيك مولكولي in vitro جهت جداسازي و دستكاري قطعات DNA مي‌باشد. با استفاده از اين تكنيك ساخت مولكول‌هاي كايمريك به نام مولكول DNA نوتركيب، سپس واردكردن اين مولكول نوتركيب به سلول‌هاي زنده، همانندسازي و تكثير آنها در سلول امكان پذير شد. امروزه تكنولوژي فيوژن پروتئين يك استراتژي براي دسترسي سريع، ارزان و پربازده بيان پروتئين هاست. توالي نوكلئوتيدي ژن اپسيلون كلستريديوم پرفرينجنز تيپ (D (etxD و ژن آلفاي كلستريديوم سپتيكوم (csa) از GenBank به دست آمد. سپس جهت توليد فيوژن پروتئين كايمريك، فيوژن ژن اپسيلون- آلفا طراحي گرديد. ساختارهاي دوم وسوم و ويژگي هاي فيوژن پروتئين حاصل به وسيله نرم افزارهاي آنلاين تعيين شد.نتايج نشان داد ساختار فيوژن ژن طراحي شده براي بيان فيوژن پروتئين كايمريك مناسب است.

Recombinant DNA technology  is an in vitro molecular techniques to isolate and manipulate DNA fragments. Using this technique, construction chimeric molecules, called recombinant DNA molecules, then insert the recombinant molecules to living cells, replication and proliferation of the cells was possible. The fusion protein technology is the strategy to achieve rapid, cheap and efficient expression of proteins. Clostridium perfringens type D epsilon gene nucleotide sequence (etxD) and Clostridium septicum alpha gene (csa) were retrieved from GenBank. Then, to produce chimeric fusion protein, epsilon-alpha fusion gene was designed. Secondary and tertiary structures and characteristics of the fusion protein was determined by online software. The results showed that the designed fusion gene construction is suitable to expression of chimeric fusion protein.