بررسي اثر نانوذرات اكسيد مس روي ژنوم باكتري اشريشياكلي با استفاده از نشانگرهاي مولكولي RAPD

An investigation of the effect of copper nanoparticles on E.coli genome by RAPD molecular markers

با توجه به مقاومت باكتري ها نسبت به آنتي بيوتيك ها و عوامل ضد ميكروبي مرسوم، تحقيقات بسياري براي يافتن انواع جديد عوامل ضد ميكروبي موثر انجام شد. با توسعه فناوري نانو، مس به طور فزاينده اي به شكل نانوذرات با فعاليت هاي ضد ميكروبي بالا و قيمت ارزان عليه همه باكتري هاي گرم منفي و گرم مثبت مورد استفاده قرار گرفته است. در اين تحقيق از نانو ذره اكسيدمس با اندازه (كمتر از 10 نانومتر) براي بررسي اثر آن روي ژنوم باكتري اشريشياكلي سويهO157:H7 به عنوان مدل براي باكتريهاي گرم منفي استفاده شد. بدين منظور ابتدا باكتريها را با غلظتهاي 30 و 60 ميكروگرم بر ميلي ليتر با اين نانوذرات تيمار كرده و در فاصله هاي زماني 2، 4 و 24 ساعت خاصيت ضد ميكروبي نانوذره بررسي گرديده و استخراج DNA صورت گرفت. تكنيك واكنش زنجيره اي پليمراز رپيد ( RAPDPCR) جهت بررسي اثر نانوذره اكسيدمس روي ژنوم به كار گرفته شد. با استفاده از نرم افزار NTSYSPC، نتايج حاصل از الكتروفورزيس محصولات PCR روي ژل آگارز مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. در اين تحقيق مشاهده گرديد كه علاوه بر اثر مهاركنندگي نانوذرات اكسيدمس، روي رشد باكتريها مشخص شد كه اين نانوذرات روي توالي DNA ژنومي اين باكتري اثر گذاشته و باعث تغيير آن در نقاط مختلف گرديد.

AbstractRegarding the bacterial resistence of common antibiotecs and antimicrobial agents , a great number of studies have been conducted to discover the recent types of antimicrobial agents. With the recent developments in nanotechnology, copper has been extensively used as nanoparticles against all positivegram and to negativegram particles due to its low price and high antimicrobial activity.In the present study, copper oxide nanoparticles of (<20 nm) have been used to study its effect on the genome of Escherichia coli strain O157: H7 as a model for Gramnegative bacteria.To this end, the bacteria were first treated with 30 and 60 µg/mL copper oxide nanoparticles at the intervals of 2, 4, and 24 hours. and then their DNA were extracted.In order to investigate the effects of copper oxide nanoparticles on the genome, the chain reaction techniques of (RAPDPCR) was employed. Using the software NTSYSPC, the results obtaind from electrophoresis of PCR products on agaros gel were analyzed.The results of the studiy revealed that copper oxide nanoparticles not only affects the growth of bacteris but also affect the sequencing of genomic DNA and leads to the changes of them in different points.Key words: nanoparticles copper oxide , Escherichia coli , Rapid polymerase chain reaction (RAPDPCR)