تعيين ساب‌تايپ‌هاي ويروس هپاتيت C در بيماران تالاسمي ايران به روش آناليزفيلوژنتيك ناحيه NS5b

Determination of Hepatitis C virus subtypes in thalassemia patients by phylogenetic analysis by NS5B region

چكيده سابقه و هدف بيماران تالاسمي به تزريق مكرر خون نياز دارند و در معرض خطر ابتلا به هپاتيت C هستند. بالا بودن فراواني اين ويروس در جمعيت تالاسمي، عوارض سنگين ناشي از آلودگي با آن و اهميتي كه تعيين تيپ‌ ويروس در درمان آلودگي دارد، از دلايل انجام اين تحقيق بود. اين مطالعه با هدف شناسايي آلودگي مزمن در بيماران تالاسمي و تعيين تيپ‌هايي از ويروس كه اين گروه با آن آلوده هستند، انجام گرفت. مواد و روش‌ها در يك مطالعه توصيفي، 120 بيمار تالاسمي anti-HCV مثبت در دو شهر تهران و آمل بررسي شدند. پس از توالي‌يابي محصولات PCR ، تعيين تيپ نمونه‌ها با رسم درخت فيلوژنتيك صورت گرفت. يافته‌ها توسط آزمون‌هاي كاي‌دو، t و دقيق‌فيشر و 22 SPSS تجزيه و تحليل شدند. يافته‌ها نتايج به دست آمده نشان داد 67 (8/55%) بيمار از نظر RNA ويروس مثبت بودند، از اين بيماران 34 (3/28%) بيمار از تهران و 33 (5/27%) بيمار از شهر آمل بودند. از 67 سويه ويروس، توانستيم 65 مورد را تعيين تيپ كنيـم. از ايـن نمونه هـا 35 (8/53%) بيمـار تيپ a1، 20 (7/30%) بيمار تيپ a3، 9 (8/13%) بيمار تيپb 1و 1 (7/1%) بيمار با تيپ a4 آلوده بودند. نتيجه گيري اعمال راه‌كارهايي كه بتوان بيماران تالاسمي مبتلا به عفونت مزمن در مراكز تالاسمي را شناسايي كرد، ضروري مي‌باشد. از آن جايي كه تيپ 1 اين ويروس به درمان رايج انترفرون و ريباورين در مقايسه با تيپ‌هاي 2 و3 با درصد پايين‌تري پاسخ مي‌دهد، غالب بودن تيپ 1 در بين بيماران تالاسمي در درمان بيماران داراي اهميت خاصي است.

Abstract Background and Objectives Patients with thalassemia are one of the at risk groups for acquiring Hepatitis C virus (HCV) infection. They need to be transfused regularly. High prevalence of this virus in thalassemia population, complications of HCV infection and the important effect of HCV genotype determination in treatment of the virus were the reasons for performing this research. The aims of the present study were to detect thalassemia patients with chronic infection and determinate the HCV subtypes distribution in this group. Materials and Methods The study was concluded on 120 specimens for HCV antibody from thalassemia patients in Tehran and Amol cites. After sequencing of PCR products, determination of HCV subtypes was performed by construction of phylogenic trees. ?2, t, Fisher exact test and SPSS 22 have been used for data analysis. Results The results showed that 67 (55/8 %) of the 120 specimens were positive for HCV RNA, 34 (28.3%) from Tehran and 33 (27.5%) from Amol. 65 specimens could be genotyped. Subtype 1a accounted for 53/8 % (n=35), 3a for 30.7 % (n = 20), 1b for 13/8 % (n = 9) and 4a for 1/7 % (n = 1) of infected cases. Conclusions Implementation of effective strategies for detection of thalassemia patients, with HCV chronic infection in thalassemia centers is necessary. The predominance of genotype 1 among thalassemia patients is important in treatment of these patients because genotype 1 indicates lower rate of sustained viral response to current therapy (Interferon and Ribavirin ) compare to HCV genotype 2 and 3.