حساسيت صحت پيش بيني هاي ژنومي تك صفتي و چندصفتي به معماري ژنتيكي صفات

در تحقيق حاضر صحت پيش بيني هاي ژنومي تك صفتي و چندصفتي در حالت وجود 10، 50، 150 و 500 جايگاه كنترل كننده صفات كمي (QTL) موثر بر دو صفت با توارث پذيري 1/0 و 6/0 و در حالت وجود پنج توزيع آماري نرمال، يكنواخت،t ، گاما و لاپلاس براي آثار QTLها با استفاده از شبيه سازي تصادفي مورد بررسي قرار گرفت. بدين منظور ژنومي به طول 10 مورگان شبيه سازي شد و 10000 نشانگر با فواصل يكسان بر روي آن قرار گرفت. در هر سناريو QTL ها به صورت تصادفي بر روي ژنوم پخش شدند و اثر جايگزيني آن ها از يكي از پنج توزيع مذكور گرفته شد. براي ايجاد عدم تعادل پيوستگي بين نشانگرها و QTL ها به مدت 50 نسل از رانش ژنتيكي استفاده شد. سپس در نسل 51 كه جمعيت مرجع نام دارد تعداد حيوانات به 1000 حيوان افزايش يافت و براي اين حيوانات يك ارزش فنوتيپي شبيه سازي شد. اثر نشانگرها در اين جمعيت با استفاده از روش بهترين پيش بيني نااريب خطي (BLUP) و تجزيه هاي تك صفتي و چندصفتي برآورد شد. با استفاده از اين اثرات برآوردي و ژنوتيپ نشانگرها براي افراد جوان نسل 52 كه جمعيت تاييد نام دارد و فاقد فنوتيپ بود، ارزش هاي اصلاحي ژنومي حيوانات محاسبه شده و صحت اين ارزش هاي اصلاحي مبناي مقايسه سناريوهاي مختلف اين تحقيق بود. نتايج اين تحقيق نشان داد كه در همه سناريوهاي مورد بررسي صحت ارزش هاي اصلاحي صفت با توارث پذيري بالا بيش تر از صفت با توارث پذيري پايين بود. همچنين ارزيابي هاي چندصفتي وقتي كه همبستگي ژنتيكي بين صفات 6/0 بود، باعث افزايش ده درصدي صحت ارزش هاي اصلاحي صفت با توارث پذيري پايين شد، ولي تاثيري بر صحت ارزش هاي اصلاحي صفت با توارث پذيري بالا نداشت. در همه سناريوهاي مورد بررسي تغيير در تعداد QTL هاي كنترل كننده صفات و هم چنين تفاوت توزيع آثار QTL ها تاثيري بر صحت ارزش هاي اصلاحي ژنومي توسط روش BLUP نداشت. در نتيجه تجزيه هاي چندصفتي روش BLUP بدون هيچ گونه حساسيتي به معماري صفت مي توانند در ارزيابي ژنتيكي صفات با توارث پذيري پايين مورد استفاده قرار گيرند.