بررسي ارتباط بين چندشكلي ژن ميوستاتين و صفات كمي ماهي قزل آلاي رنگين-كمان پرورشي (Oncorhynchus mykiss) با روش PCR-SSCP

در مطالعه حاضر توالي ژن ميوستاتين قزل آلاي رنگين كمان بررسي و ارتباط بين چندشكلي هاي تك نوكليوتيدي (SNPs) اين ژن با صفات كمي رشد با استفاده از روش هاي توالي يابي و PCR-SSCP مورد آناليز قرار گرفت. به همين منظور تعداد 20 عدد قزل آلاي رنگين كمان مولد موجود در مركز تحقيقات ژنتيك و اصلاح نژاد ماهيان سردآبي ياسوج انتخاب و علامت گذاري (به روش دستي)و سپس بچه ماهيان حاصل از تكثير آنها در شرايط پرورشي مناسب و يكسان در يك دوره پنج ماهه نگهداري شدند. در ادامه براي آزمايشات مولكولي استخراج ژنوم طبق روش استاندارد از نمونه هاي بچه ماهي به صورت تصادفي صورت پذيرفت. تعداد دو جهش تك نوكليوتيدي (g.660T > C و g.1904C > A ) در نواحي اينترون 1 و 2 ژن ميوستاتين با استفاده از روش توالي يابي DNA و PCR-SSCP شناسايي شد. در مجموع تعداد 6 هاپلوتيپ در بين نمونه هاي بچه ماهي اين مركز بدست آمدند. آزمون پيوستگي هاپلوتيپ و صفات كمي وزن و طول از شاخص هاي رشد نشان داد بين ژنوتيپ هاي TC و CC در نقطه g.1904C > A ارتباط معني داري با طول و وزن در زمان 90 و 150 روزگي بچه ماهيان وجود دارد (05/0p < ) ولي ارتباط معني داري بين هاپلوتيپ هاي SNP g.660T > C و صفات كمي مشاهده نگرديد. نتايج اين تحقيق نشان داد كه وزن و طول بچه ماهيان انگشت قد قزل آلاي رنگين كمان با ژن ميوستاتين مرتبط بوده و اين ژن مي تواند به عنوان ژن كانديد سودمند در برنامه هاي انتخاب به كمك نشانگر (MAS) گونه قزل آلاي رنگين كمان مورد استفاده قرار گيرد.

In this study the rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) myostatin gene (MSTN) for detecting gene derived SNPs and performing genetic association study between MSTN polymorphisms and growth traits were analyzed. Twenty broodstocks of rainbow trout in Genetic and Breeding for coldwater Fishes center in Yasouj for generating full sibling were selected and tagged and then juveniles were raised at the ponds until 5 months post-hatching. DNA extract based on standard method and these individuals selected randomly for molecular analysis. Two single nucleotide polymorphisms (SNPs: g.660T > C and g.1904C > A) in intron 1 and 2 regions of the MSTN gene in rainbow trout by were identified DNA sequencing and polymerase chain reaction single-stranded conformational polymorphism (PCR-SSCP) methods. The assessment results demonstrated that 6 haplotypes were revealed in this center. Moreover, association analysis indicated that the genotypes of SNP g.1904C > A are associated with the length and body weight at 90 and 150 days of age (p < 0.05), whereas no significant association was found between the SNP g.660T > C and growth traits. Our results provided evidence that SNPs in MSTN gene may be associated with length and body weight at fingerling age and MSTN gene may be used as potential candidate gene for marker-assisted selection (MAS) in rainbow trout breeding program.