تعيين هويت مولكولي و شجره شناسي بر اساس ژن نوكلئوكپسيد ويروس برونشيت عفوني پرندگان جدا شده از گله هاي گوشتي در سالهاي 1393-1394

زمينه مطالعه: برونشيت عفوني يك بيماري مهم از نظر اقتصادي در ماكيان بوده كه به دليل ظهور ژنوتيپ هاي جديد ويروس برونشيت عفوني، كنترل اين بيماري بعنوان يك مشكل جدي در صنعت طيور در دنيا مطرح است و پيش از اين، مطالعه جامعي برروري اين ژن بر روي ژنوتيپ هاي سال هاي اخير مختلف كشور انجام نگرديده بود. هدف: لزوم از انجام اين مطالعه تعيين هويت مولكولي و شجره شناسي بر اساس ژن نوكلئوكپسيد ويروس برونشيت عفوني جدا شده از گله هاي گوشتي ايران در سال هاي 1393-1394 مي باشد. روش كار : در اين بررسي ژن نوكلئو كپسيد ده جدايه از چهار نوع ژنوتيپ متفاوت ويروس برونشيت عفوني با استفاده از پرايمر هاي اختصاصي تكثير و با نرم افزار هاي مناسب شجره شناسي و تعيين ساختار مورد تجزيه و تحليل قرار گرفتند. نتايج : از نظر شجره شناسي ويروس هاي برونشيت عفوني گروه ماساچوست، QX و 793/B در گروه خود قرار گرفتند و ژنوتيپ ويروس واريانت 2 در كنار ساير ويروس هاي جدا شده از ايران قرار داشتند. در صد تشابه بر اساس اسيد آمينه، بين سويه هاي مختلف مورد مطالعه بين 97/89 تا 75/99٪ تشابه وجود داشت. بيشترين تشابه بين دو ژنوتيپ IBKG-1و IBKG-8 مورد مطالعه در گروه 793/B و كمترين تشابه بين دو ژنوتيپ QX و واريانت 2 (ويروس هاي IBKG-5 و IBKG-9) بوده، كه اين ميزان تفاوت براي ژن نوكلئوكپسيد (محافظت شده) نسبتاًً بالا مي باشد. بررسي بيوانفورماتيك نشان داد كه پروتئين در اين ويروس ها بين ۶ تا ۷ صفحه بتا و بين ۸ تا ۱۰ مارپيچ آلفا دارند. نتيجه گيري نهايي: نتايج حاصل از اين مطالعه مي تواند اطلاعات مناسبي در زمينه استفاده از اطلاعات اين پروتيئن در توليد پروتئين هاي نو تركيب جهت توليد كيت هاي الايزا و روش هاي تشخيص سريع، واكسن هاي نو تركيب و همچنين اپيدميولوژي مولكولي اين بيماري ويروسي مهم در كشور نمايد.