بررسي تنوع ژنتيكي ارقام مختلف انگور Vitis vinifera با استفاده ازنشانگر مولكولي ISSR

Investigation of genetic divers ity in different grape varieties (Vitis vinifera ) using ISSR molecular marker

انگور يكي از محصولات مهم باغي در دنيا و ايران به شمار مي‌رود و از تنوع ژنتيكي بالايي برخوردار است لذا هدف در اين پژوهش بررسي تنوع ژنتيكي و ارزيابي ارقام مطرح انگور (Vitis vinifera) در سطح مولكولي با استفاده از نشانگر ISSR بود. به منظور استخراج DNA از روش تغيير يافته Doyle and Doyle استفاده شد و در گام بعد 12 ژنوتيپ با 12 آغازگر مورد بررسي قرار گرفتند. تجزيه خوشه‌اي با دو نرم‌افزار PopGen32 و SPSS9 انجام شد. خوشه‌بندي حاصل با هردو نرم افزار واريته‌ها را در 5 گروه مجزا قرار داد. در تجزيه داده‌ها، درصد پلي‌مورفيسم 96/49 درصد و تعداد لوكوس پلي‌مورف 55 بدست آمدند. ضريب كوفنتيك براي ضريب تشابه جاكارد و ني، 0/8 است كه نشان دهنده برازش خوب بين دندروگرام و ماتريس شباهت اصلي است. باندهايي كه به طور واضح قابل مشاهده بودند مورد بررسي قرار گرفتند. نتايج نشان داد كه در مجموع 353 باند توسط اين نشانگرها توليد شد. اندازه باندها بين 200 تا 3000 جفت باز متغير بود. در اين بين بيشترين تشابه براي واريته‌هاي 1 (سبز شاه پسند) و 7 (خليلي بيدانه قوچان) با مقدار 0/619 و كمترين تشابه براي واريته‌هاي 10(پير قلي شماره2) و 2 (مال كاشمر) با مقدار 0/205 بود. از آنجا كه بيشترين ميزان باند توسط آغازگر 56 a باند) مشاهده شد، اين آغازگر بهتر از ساير آغازگرها توانست فاصله ژنتيكي واريته‌هاي مربوط به آغازگر را مشخص كند.

Grapes is one of the most important horticultural products in the world and Iran and has a wide genetic diversity, so the purpose of this research was to investigate of the genetic diversity and to asses ofintroduced grapes cultivars (Vitis vinifera) at the molecular level using ISSR marker. For DNA extraction modified method of Doyle and Doyle was used and at the next step, 12 genotypes were examined by 12 primers. Cluster nalysis was performed by PopGen32 and SPSS9 softwares. The resulted clustering were divided cultivars into 5 groups by both softwares. In analyzing data, the percentage of olymorphism and the number of polymorphic loci were obtained 96.49 percent and 55, respectively. Cophenetic coefficient was 0.8 for Jaccard coefficient and straw, is indicating a fine fit between the dendrogram and the main similarity matrix. The bands that were obviously visible were reviewed. Results showed that a total of 353 bands were generated by the markers. Results showed that a total of 353 bands were generated by the markers. Results showed that 353 bands were generated by the markers. The size of bands was various between 200 and 3000 bp. The highest similarity was 0.619 for number one and number 7 varieties and the least one was 0.205 for umber10 and number 2 varieties. Because the most amount of bond were observed by primer a (56 bands), this primers was able to determine the genetic gap of Primerrelated varieties better than other primers.