تعيين ويژگي هاي ژنتيكي سويه هاي مايكوباكتريوم ايويوم زير گونه پاراتوبركولوزيس III & V و 316F با استفاده از يك راهبرد چندگانه

Molecular identification of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis 316F and III & V strains by a multi-approach strategy

دو سويه غير بومي (Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP 316F و MAP III & V به مدت نيم قرن در موسسه رازي نگهداري و از آن ها براي تهيه پاراتوبركولين استفاده شده است. به منظور شناسايي خصوصيات ژنتيكي اين دو سويه يك استراتژي سه محور تعيين هويت (PCR-IS900، PCR-F57)، تعيين تيپ (PCR-Collins، PCR-gyrA، PCR-gyrB) و تعيين ژنوتيپ (MLVA-Thibault، SSR-Amonsin) به كار گرفته شد. در نتيجه اجراي اين استراتژي هويت هر دو سويه به عنوان MAP تاييد گرديد و تيپ آنها از نوع گاوي شناخته شد. در ژنوتايپينگ تيپ MLVA آن ها INMV2 نشان داده شد كه با نمونه فرانسوي (Merial) سويه MAP 316F همخواني دارد. در تفسير اين يافته ها مي توان گفت شباهت تيپ ژنتيكي دو سويه در SSR-Amonsin و MLVA-Thibault ممكن است اتفاقي باشد و يا نشانگر تعلق آنها به يك كلون اجدادي واحد باشد. علاوه بر اين چون موسسه اتليك تركيه تامين كننده سويه MAP 316F مورد بررسي در اين تحقيق مي باشد، بنابراين احتمالا يك منبع فرانسوي تامين كننده اين سويه براي موسسه اتليك تركيه بوده است. انتظار مي رود اجراي اين استراتژي بر روي جدايه هاي بومي ايران دانش مولكولار اپيدميولوژي موجود را در رابطه با پاراتوبركولوزيس در ايران افزايش دهد.

For almost half a century Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) 316F and MAP III & V strains have been used in preparation of paratuberculin at Razi institute. In order to characterize their genomic properties, a multi-approach strategy was employed to authenticate their identity (PCR-IS900 or PCR-F57), their type (PCR-Collins, PCR-gyrA or PCR-gyrB) and their genotype (MLVA-Thibault or SSR-Amonsin). Consequently, both strains proved to be MAP and from a cattle type. In MLVA the genotype was found to be INMV2, a type identical to that of the French MAP 316F Merial sub-strain. In explanation of these observations, the identical patterns of both studies strains in MLVA as well as SSR typing might be a case of coincidence or a an indication of a mutual ancestral clone. Besides, the fact that the supplier of MAP 316F strain studied here is the Turkish Etlik institute, it is likely that the original source for this strain is French. Application of the strategy developed in this study on indigenous MAP isolates will improve the current molecular epidemiology understanding of paratuberculosis in Iran.