بررسي تنوع ژنتيكي تعدادي از ژنوتيپ هاي زراعي و وحشي جو با استفاده از نشانگرهاي مولكولي AFLP

Investigatingthe genetic diversity in some of cultivated and wild barely genotypes using AFLP molecular markers

دراين مطالعه،ازنشانگرهاي مولكولي AFLP براي بررسي تنوع ژنتيكي بين 24 ژنوتيپ جو استفاده شد. هشت تركيب آغازگري EcoRI/Tru1I، در مجموع 332 نوار قابل امتيازدهي ايجاد كردند كه 292 عدد (15/89 درصد) از آن ها چند شكل بودند. تنوع ژنتيكي محاسبه شده با روش ني در محدوده ۰/۳۸-۰/۲۹ بود. شباهت ژنتيكي ژنوتيپ ها نيز بين 20/0 تا ۰/۵۶ متغير بود.بيشترين و كمترين درصد چندشكلي به ترتيب در تركيب هاي آغازگري ACG- Tru1I+CGA+EcoRI،(۰/۴۷ درصد) و EcoRI+ACT - Tru1I+CCG، (۰/۲۶ درصد) به دست آمد. دندروگرام حاصل از تجزيه خوشه اي با استفاده از ضريب تشابه جاكارد و روش UPGMA ژنوتيپ ها را به چهار گروه اصلي تقسيم كرد. در گروه هاي اول و دوم ژنوتيپ هاي شش رديفه و در گروه هاي سوم و چهارم تركيبي از ژنوتيپ هاي شش رديفه و دو رديفه قرار گرفتند. بر اساس ماتريس ضرايب شباهت، كمترين فاصله ژنتيكي بين رقم نيمروز و ژنوتيپ جمعيتي خراسان رضوي و نيز بين نمونه جمعيتي TN2173 كرج و لاين EB-86-3 مشاهده شد. ژنوتيپ جمعيتي تيل آباد و تلاقي (F1)ALISOS/CI03909-2 نيز بيشترين فاصله ژنتيكي را نشان دادند. با توجه به مشاهده ميزان بالاي چندشكلي در بين ژنوتيپ هاي مطالعه شده در اين تحقيق مي توان از نشانگر AFLP و به ويژه تركيب آغازگري ACG- Tru1I+CGA+EcoRI كه درصد چندشكلي بالاتري را توليد كرد، به عنوان يك ابزار توانمند در تمايز ژنوتيپ هاي نزديك و ساير برنامه هاي اصلاحي جو استفاده كرد.

In this study, AFLP markers were used to investigate the genetic diversity among 24 genotypes of barley. The eight primer combinations of EcoRI/Tru1I, totally produced 332 scorable bands that 292 (89.15%) were polymorph. Genetic diversity was estimated between 0.29-0.38 using Nei's gene diversity coefficient. Also, genetic similarity of the genotypes varied from 0.20.0 to 0.56. The highest (0.47%) and lowest (0.26%) polymorphism were obtained using primer combinations of EcoRI+ACG-Tru1I+CGA and EcoRI+ACT- Tru1I+CCG, respectively. Cluster analysis using Jaccard coefficient and UPGMA method assigned genotypes to four main groups. In the first and second groups there were six-rows genotypes and in the third and fourth groups a combination of six- and two-rows genotypes. On the based on similarity matrix the genetic distance between Nimrouz and genotype population Khorasan-Razavi also genotype population of Karaje TN2173 and Line EB-86-3 was low, while the genetic distance between genotype population of Tilabad and cross (F1) ALISOS/CI03909-2 was high. Considering to achieving high rates of polymorphism in the present study can use AFLP marker specially primer combination such as ACG- Tru1I+CGA +EcoRI which produced high level of polymorphism as a powerful tool to distinguish of close genotypes and other barley breeding programs.