ژنتيك جمعيت ماهي شبه شوريده دهان سياه (Atrobucca nibe (Jordan and Thompson، 1911 در سواحل شمال غربي درياي عمان با استفاده از روش PCR-sequencing

Population genetic studies of Atrobucca nibe (Jordan & Thompson, 1911) using D-Loop sequencing in the norththwest coasts of the Oman Sea

ماهي شبه شوريده دهان سياه از ماهيان با ارزش اقتصادي مي باشد كه اطلاعات ژنتيكي اندكي از اين گونه منتشر شده است. در اين مطالعه به منظور بررسي تنوع ژنتيكي ماهي شبه شوريده دهان سياه (Atrobucca nibe) در درياي عمان با استفاده از روش توالي يابي ژن D-Loop تعداد 34 نمونه از بافت نرم باله از نواحي فجيره از كشور امارات متحده عربي و چابهار از جمهوري اسلامي ايران جدا و در اتانول 96 درصد نگهداري شد. DNA با استفاده از روش استات آمونيوم استخراج گرديد و كميت و كيفيت آن به روش هاي اسپكتروفتومتري و الكتروفورز مورد بررسي قرار گرفت. نمونه DNA هاي مطلوب ، PCR و توالي يابي شدند. توالي ناحيه D-Loop شامل 270 جفت باز بود. توالي ها توسط نرم افزار هاي Bio edit، DnaSP 5.10.0.1، Arlequen و Genepopآناليز شدند. تنوع هاپلوتيپي در فجيره، ۰/۹۳ و در چابهار، ۰/۸۳ بدست آمد. همچنين تنوع نوكلئوتيدي درفجيره به مقدار ۰/۱ و در چابهار به مقدار ۰/۰۸ ديده شد. در مطالعه حاضر مقدار هتروزيگوسيتي ديده شده در نمونه هاي چابهار ۰/۴۵ و در نمونه هاي فجيره۰/۵۰ مشاهده شد. در اين پژوهش ميزان FSTبين مناطق مورد مطالعه ميانه تخمين زده شد كه اين امر مويد تمايز بين جمعيت هاي موجود مي باشد. طبق نتايج حاصل از اين بررسي با وجود جريان ژني مطلوب، دو جمعيت متفاوت از شبه شوريده دهان سياه را مي توان در نواحي چابهار و فجيره مشاهده نمود.

Black Mouth Croaker (Atrobucca nibe) is highly valued economically and There are very few published studies on genetic of this species. In the following study، the genetic diversity of Atrobucca nibe has been investigated using the PCR-sequencing method from two different regions of the Oman Sea، namely Chabahar in the Sistan and Baluchestan Province of Iran and Fujairah in the Fujairah Emirate of the United Arab of Emirates. 34 fish have been collected from the aforementioned regions. The DNA of the fish had been extracted through the Ammonium Acetate method and the quality of the DNAs were analyzed via the spectrophotometry and furthermore the quantity of the extracted DNA were assessed via electrophoresis. Polymerase Chain Reaction (PCR) was conducted on the targeted DNAs and later DNA sequencing was carried out. Subsequently، through sequencing it was discovered that the D-loop region in the mitochondrial DNA (mtDNA) of Black Mouth Croaker،contained 270 base pairs (bp). The nucleotide diversity discovered in the conduct of the following study was varied from 0.08 (Chabahar) to 0.1 (Fujairah)، and the Haplotype diversity was estimated to be at 0.83 in Chabahar and 0.93 in Fujairah. Observed and expected heterozygosity averages were 0.47 and 0.69، respectively. So the observed heterozygosity had constantly been lower than that of the expected heterosygosity، reflecting the reduction in genetic diversity. Through observations of average levels of FST between the regions، it can be summed up that genetic differences do exist among the present populations. This study was showed there currently are two different populations of Atrobucca nibe residing in the waters of Sistan & Baluchestan and Fujairah.