عنوان مقاله :
شناسايي و تعيين ويژگي‌هاي مولكولي ويروس كوتولگي بافت مرده‌ي باقلا، يك نانوويروس جديد در مزارع حبوبات ايران
عنوان به زبان ديگر :
Identification and molecular characterization of Faba bean necrotic stunt virus, a new nanovirus in legume fields in Iran
پديد آورندگان :
لطفي پور، مائده دانشگاه شيراز - دانشكده كشاورزي - مركز تحقيقات ويروس شناسي گياهي , ايزدپناه، كرامت اله دانشگاه شيراز - دانشكده كشاورزي - مركز تحقيقات ويروس شناسي گياهي , بهجت نيا، علي اكبر دانشگاه شيراز - دانشكده كشاورزي - مركز تحقيقات ويروس شناسي گياهي
كليدواژه :
باقلا , حبوبات , كوتولگي , لوبيا , ويروس زردي بافت مرده‌ي باقلا
چكيده فارسي :
ويروس‌هاي عامل زردي و كوتولگي حبوبات از جمله نانوويروس‌ها هر ساله سبب كاهش محصول در انواع حبوبات بخصوص باقلا مي‌شوند. مهمترين ويروس خسارت‌زاي اين گروه، ويروس زردي بافت مرده‌ي باقلا (FBNYV) است. بمنظور رديابي مولكولي نانوويروس‌ها در ايران، از مزارع باقلا و لوبيا بترتيب در استان‌هاي فارس و خوزستان در سال‌هاي 1394-1393 نمونه برداري شد. در مورد نمونه‌هاي انتخابي استخراج دي‌ان‌ا، تكثير ژنوم با آغازگرهاي نانوويروس‌ها، همسانه‌سازي و تعيين ترادف انجام شد. چهار قطعه‌ي ژنوم شامل DNA-R، DNA-M، DNA-U1 و DNA-U2 تكثير و تعيين ترادف شدند. نتايج تعيين ترادف نشان داد كه اين قطعات مربوط به ويروس كوتولگي بافت مرده‌ي باقلا (Faba bean necrotic stunt virus, FBNSV) مي‌باشند. اين اولين گزارش از وقوع اين ويروس در ايران است. مقايسه ترادف ژنوم قطعات فوق‌الذكر با قطعات مشابه جدايه‌هاي FBNSV و نانوويروس‌هاي موجود در بانك ژن نشان داد كه جدايه‌هاي باقلا و لوبياي FBNSV در ايران بيشترين شباهت را با جدايه‌هاي اين ويروس از كشور آذربايجان دارند. مطالعات تبارزايي نشان داد كه FBNSV به FBNYV وMilk vetch dwarf virus (MDV) در مقايسه با Subterranean clover stunt virus نزديك‌تر مي‌باشد. در دندروگرام‌هاي رسم شده براي قطعات DNA-R و DNA-U2، FBNSV بيشترين نزديكي را با FBNYV نشان داد، در حاليكه در دندروگرام‌هاي قطعات DNA-M و DNA-U1، FBNSV به ترتيب به MDV و ويروس برگ زرد باقلا (FBYLV) نزديك‌تر بود. در تمام موارد جدايه‌هاي FBNSV از كشورهاي آذربايجان، اتيوپي، مراكش و ايران يك گروه مجزا از FBNYV را تشكيل دادند. بنظر مي‌رسد FBNSV و FBNYV دو گونه مجزا از نانوويروس‌ها باشند.
چكيده لاتين :
Viruses inducing yellowing and stunting syndrome in legumes including nanoviruses cause losses in several species particularly broad bean in Iran. One of the most damaging nanoviruses in legumes is Faba bean necrotic yellows virus (FBNYV). To detect nanoviruses in infected fields, symptomatic plants including broad bean and common bean were collected from Fars and Khuzestan provinces, respectively, in 2014-2015. DNA was extracted and subjected to PCR, cloning and sequencing using specific nanovirus primers. Four fragments of a nanovirus genome including DNA-R, DNA-M, DNA-U1 and DNA-U2 were amplified and sequenced. The results of sequencing showed that these fragments belong to Faba bean necrotic stunt virus (FBNSV). This is the first report of this virus in Iran. Sequence comparison of aforementioned genomic fragments with corresponding DNA fragments of FBNSV isolates and other nanoviruses for which nucleotide sequence information was available in GenBank indicated that both Iranian isolates of FBNSV are most similar to Azerbaijani isolates of this virus. Phylogenetic analysis showed that FBNSV is closer to FBNYV and Milk vetch dwarf virus (MDV) than to subterranean clover stunt virus. Dendrograms obtained by phylogenetic analyses of DNA-R and DNA-U2 sequences indicated that FBNSV was closest to FBNYV while in those obtained for DNA-M and DNA-U1, FBNSV was closer to MDV and Faba bean yellow leaf virus than to other nanoviruses. For all DNAs characterized in this study, FBNSV isolates from Azerbaijan, Ethiopia, Morocco and Iran formed a separate group distinct from FBNYV isolates. It seems that FBNSV and FBNYV are distinct nanovirus species.
