بررسي چند‌شكلي تك‌نوكلئوتيدي ناحيه پروموتور ژن TFAM و ارتباط آن با صفات رشد در گاو سيستاني

Polymorphism of TFAM gene and its association with growth traits in Sistani cattle

گاو سيستاني نژاد گوشتي و از ذخاير ژنتيكي با‌ارزش كشور است كه از لحاظ توليد گوشت، كميت و كيفيت لاشه و بازده غذايي مناسب است. در پژوهش حاضر به منظور بررسي چند‌شكلي ژن TFAM (Mitochondrial transcription factor A) با استفاده از PCR-RFLP، از 150 رأس گاو سيستاني به صورت تصادفي و انفرادي خونگيري از وريد گردني انجام گرفت. سپس نمونه‌‌هاي خون دام‌ها با روش شستشوي نمكي بهينه شده استخراج و كيفيت آنها با الكتروفورز ژل آگارز 1 درصد بررسي گرديد. ناحيه پروموتور جايگاه TFAM به طول bp801 با روشPCR تكثير و محصول PCR توسط آنزيمBsuRI برش داده شد. محصولات هضم شده توسط الكتروفورز با ژل آگارز 3 درصد و رنگ آميزي اتيديوم برومايد نمايان‌سازي گرديد. با توجه به اين كه آنزيم برشي مذكور در قطعه تكثير شده داراي چندين سايت برشي مي‌باشد، نتايج الگوي هضمي در حيوانات هموزيگوت (AA) سه باند با اندازه 152، 187 و 462 جفت باز، در حيوانات هموزيگوت (CC) چهار باند با اندازه 83، 104، 152 و 462 جفت باز و نهايتاً در حيوانات هتروزيگوت (AC) پنچ باند با اندازه‌هاي 83، 104، 152، 187 و 462 جفت باز مشاهده گرديد. داده‌هاي آماري با استفاده نرم افزار POPGENE3.2 مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. جمعيت در جايگاه TFAM انحراف از تعادل هاردي- واينبرگ را نشان داد(0/05>P). شاخص شانون(I)، شاخص نئي، هتروزيگوسيتي مشاهده شده و هتروزيگوسيتي مورد انتظار به ترتيب، 69، 49، 37، 50 درصد محاسبه شد. در مطالعه حاضر ارتباط معني‌داري بين ژنوتيپ‌هاي گاو سيستاني در جايگاه ژنTFAM با صفات رشد مشاهده نشد.

Sistani beef cattle is a native breed of east of Iran that as a valuable genetic resource in the tropical area could be good a candidate to produce high quantity of muscular carcass portions with high efficiency. In order to explore the Mitochondrial transcription factor A gene (TFAM) polymorphisms using PCR - RFLP, 150 Sistani cows were randomly selected and then blood samples were taken from the jugular vein of each animal individually. Thereafter, bloo d samples were salting - out and electrophoresed with 1% agarose gel. The position of the TFAM promoter region amplified by PCR and PCR products with 801bp length were sliced by BsuRI enzyme. Digestion products on 3% agarose gel were shown by electrophoresis and staining with ethidium bromide. The patterns of digestion in AA homozygotes, CC homozygotes, and AC heterozygotes were as follows: three bands with 152, 187, and 462bp; four bands with 83, 104, 152, and 462bp; and five bands with 83, 104, 152, 187, an d 462bp, respectively. The results showed that the position of TFAM population deviated from the Hardy - Weinberg equilibrium (P <0.05). Shannon index (I), Nei index, observed heterozygosity, and expected heterozygosity were 0.69, 0.49, 0.37, and 0.50, respe ctively. In conclusion, no significant differences between genotypes of Sistani cattle were observed for TFAM gene polymorphism and growth traits