خالص سازي، تهيه آنتي سرم و تعيين جايگاه تاكسونوميكي جدايه آفتابگردان ويروس موزاييك زرد لوبيا بر اساس ترادف ناحيه CI ژنوم

Virion purification, antiserum production and taxonomic position of Iranian sunflower isolate of Bean yellow mosaic virus (BYMV) based on sequence of CI region of the genome

ويروس موزاييك زرد لوبيا (از خانواده پوتي ويريده و جنس پوتي ويروس) با دارا بودن دامنه ميزباني وسيع مي تواند بر روي محصولات مختلف خسارت زيادي وارد كند. اخيرا اين ويروس براي اولين بار به صورت طبيعي از مزارع آفتابگردان استان اصفهان شناسايي شده است. در اين پژوهش ويژگي هاي يك جدايه ي انتخابي با نام اختصاري BYSun مورد بررسي قرار گرفت. خالص سازي فيزيكي جدايه ي مورد مطالعه با استفاده از دو دور سانتريفوژ افتراقي بر روي بالشك هاي سوكروز 20% و 30% انجام شد. از هر 100 گرم بافت آلوده حدود 20-15 ميلي گرم ويروس خالص به دست آمد. وزن مولكولي پروتئين پوششي آموده ويروس خالص BYSun به روش SDS-PAGE، 5/33 كيلو دالتون برآورد گرديد. آنتي سرم جدايه مورد بررسي با استفاده از پنج تزريق هفتگي آموده خالص ويروس به خرگوش تهيه شد. نتايج آزمون اليزا نيز مشخص كرد رقت 2500/1 گاماگلوبولين اين آنتي سرم از نظر اقتصادي مناسب ترين رقت مي باشد. مقايسه ترادف نوكلئوتيدي و آمينو اسيدي به دست آمده از ناحيه CI ژنوم با ترادف هاي موجود در GenBank در پايگاه اطلاعاتي NCBI با استفاده از برنامه BLAST بيشترين شباهت را با جدايه BYMV-S از استراليا نشان داد. تجزيه و تحليل درخت هاي فيلوژنتيك حاصل از مقايسه ترادف اين ناحيه از ژنوم جدايه ي BYSun با ساير جدايه هاي BYMV نشان داد اين جدايه ها در شش گروه General، Lupin، Broad bean ، W ، Pea و S قابل تفكيك هستند كه تا حدود زيادي با منشاء ميزباني آن ها مطابقت دارد. جدايه BYSun به همراه BYMV-S در شاخه S جاي مي گيرد.

Bean yellow mosaic virus (BYMV) is a member of genus Potyvirus within the large and economically important family Potyviridae. During 2010-2012 growing seasons، a BYMV isolate was detected in sunflower fields of Isfahan province (Iran)، tentatively designated as BYSun. Virions of BYSun were purified using two cycles of differential centrifugation on 20% and 30% sucrose cushions. SDS-PAGE of purified virus preparations revealed a single protein band with MW of about 33.5 kDa for BYSun. The prepared antiserum against BYSun reacted specifically with infected but not with healthy broad bean sap in serological tests. A 680 bp DNA fragment، corresponding to the partial CI (cylindrical inclusion) region of the viral genome of four selected isolates، was amplified using CIRev/CIFor primers able to detect members of the family Potyviridae. BLAST search showed that the most similar sequence in the databases was that of BYMV-S. Nucleotide sequence identities of BYSun whole genome to those of other BYMV isolates ranged from 75 to 98%. The deduced amino acid sequence of BYSun polyprotein was 85-99% identical to other isolates of BYMV. Phylogenetic analysis of most parts of the genome (especially CP) of different BYMV isolates sequences revealed eight distinct groups including General، Lupin، Monocot، Broad bean، W، Pea، Canna and S. These groups correlated with original natural isolation hosts. BYSun and BYMV-S grouped apart from other isolates، so it was placed within a distinct group called “S”. BYSun is the first isolate of BYMV with fully sequenced genome in Iran.