ارزيابي مولكولي قابليت توليد سيدروفور در سويه هاي سودوموناس فلوروسنت، عامل كنترل كننده پوسيدگي ريشه در چغندر قند

Molecular assessment of siderophore production ability in Pseudomonas fluorescent strains, as a control agent of root rots in sugar beet

از مهم ترين بيماري هاي چغندرقند، پوسيدگي ريشه مي باشد كه عامل آن قارچي خاكزي بنام Rhizoctonia solani است. باكتريهاي خاكزي زيادي از جمله سودوموناس ها در اثر توليد موادي نظير سيدروفور باعث كنترل اين بيمارگرهاي خاكزاد مي شوند. لذا در اين تحقيق پس از شناسايي سودوموناس هاي فلورسنت در فراريشه مزارع چغندرقند سبزوار و بررسي توان بازدارندگي اين باكتريها از رشد قارچR. solani ، رديابي ژن بيوسنتز سيدروفور صورت گرفت. به اين منظور نمونه هاي گياه همراه با خاك فراريشه اي آن جمع آوري شدند. جهت به دست آوردن سودوموناس ها از محيط كشت اختصاصي سودوموناس آگار F استفاده شد. كشت خالص هر جدايه، پس از 2 واكشت روي همان محيط تهيه گرديد و 3 سويه فلورسنت براساس مطالعات ميكروسكوپي و آزمون هاي فيزيولوژيك و بيوشيميايي تفكيك و شناسايي شدند. براي بررسي ميزان بازدارندگي جدايه هاي سودوموناس فلورسنت از رشد قارچ R. solani، آزمون كشت متقابل باكتري و قارچ انجام شد. بر اساس ميزان هاله بازدارندگي، مشخص شد كه سويه C7 با بازدارندگي شديد، سويه C3 با بازدارندگي متوسط و سويه C5 بدون خاصيت بازدارندگي است. همچنين بررسي وجود ژن بيوسنتز سيدروفور با PCR در اين باكتريهاي سودوموناس فلورسنت نشان داد كه تنها نمونه C7 واجد ژن بيوسنتز سيدروفور مي باشد.

Root rot is the most important disease of sugar beet caused by Rhizoctonia solani fungus which lives in soil. Many soil bacteria such as Pseudomonas spp. by production of materials such as siderophores could control soil borne pathogens. So in this study, after identifying Pseudomonas fluorescents in the rhizosphere of Sabzevar sugar beet fields and the assessment of the bacteria to inhibit R. solani growth, detection of siderophore biosynthetic gene was performed. For this purpose, plant samples along with its rhizosphere soil were collected. To obtain specific Pseudomonas, Pseudomonas agar F medium was used. After 2 subcultures on the same medium, three Pseudomonas fluorescent strains based on microbial tests were identified. To evaluate the growth inhibition of R. solani by Pseudomonas fluorescent, dual culture tests were done. Based on inhibition areola, it was shown that C7 and C3 isolates have severe and moderate deterrence respectively but C5 strain has no deterrent effect. PCR results also showed that only C7 isolate contained siderophore biosynthetic genes.