ارزيابي ژنتيكي جمعيت هاي مختلف گياه دارويي زيره سبز با استفاده از نشانگرهاي مولكولي DNAISSR

Genetic evaluation of different population of Cumin (Cuminum cyminum L.) using DNA molecular markers

در اين تحقيق سعي شد تا روابط خويشاوندي و فاصله ژنتيكي جمعيت هاي زيره سبز مورد ارزيابي قرار گيرد. تعداد پنج جمعيت زيره سبز جمع آوري و با استفاده از 10 آغازگر RAPD و 10 آغازگر ISSR بررسي خواهد شد. داده ها با استفاده از نرم افزارهاي NTsys pc2. 1، GenAlex6. 501 و Popgene32 تجزيه و تحليل خواهند شد. در نشانگر RAPD در مجموع 182 باند تكثير كه آغازگرTIBMBC03 داراي بيشترين تعداد باند (27) ، شاخص ماركري (12/15) و شاخص چندشكلي (0/5) و در نشانگر ISSR در مجموع 135 باند تكثير كه آغازگر UBC809 داراي بيشترين تعداد باند (18) ، شاخص ماركري (7/56) و شاخص چندشكلي (0/42) بودند. در نشانگر RAPD، بيشترين ميزان شاخص تنوع ژني ني (0/32) و شاخص شانن (0/233) متعلق به جمعيت زيره سبز سبزوار و در نشانگر ISSR نيز بيشترين ميزان شاخص تنوع ژني ني (0/18) و شاخص شانن (0/27) متعلق به جمعيت زيره سبز سبزوار بود. كمترين ميزان تشابه (0/144) بر اساس نشانگر RAPD مربوط به زيره سبز سبزوار و زيره سبز كاشان و در نشانگر ISSR نيز كمترين ميزان تشابه (0/085) مربوط به زيره سبز سبزوار و زيره سبز كاشان و همچنين بر اساس اطلاعات حاصل از نشانگر RAPD و ISSR توام، كمترين ميزان تشابه (0/117) مربوط به زيره سبز سبزوار و زيره سبز كاشان بود. در كل نتايج اين تحقيق نشان داد كه زيره سبز سبزوار به عنوان مركز تنوع اين گياه بر اساس جمعيت هاي مورد بررسي پيشنهاد و دورترين جمعيت ها جهت تلاقي هاي احتمالي و ايجاد تنوع جديد و مفيدتر زيره سبز سبزوار و زيره سبز كاشان معرفي مي شوند.

Iran is one of the richest sources of medicinal plants in the world with high variability in habitat conditions for a variety of these plants. Therefore, in this study tries to kinship and genetic distance between populations is assessed cumin. A total of five population of cumin were collected and then were analyzed using 10 RAPD primers and 10 ISSR primers. To analysis of data will be used NTsys pc2.1, GenAlex6.501 and Popgene32 software. The RAPD primers gave 182 Amplified bands that TIBMBC03 primer had the highest bands (24), marker index (12.15) and diversity index (0.5) and The ISSR primers gave 135 Amplified bands that UBC809 primer had the highest bands (18), marker index (7.56) and diversity index (0.47). In RAPD marker, the highest Nei diversity (0.32) and Shanoon diversity (0.333) was belong to cumin of Sabzvar and also in ISSR marker the highest Nei diversity (0.18) and Shanoon diversity (0.27) was belong to cumin of Sabzvar. According to RAPD marker, the lowest value of similarity (0.114) between Sabzvar and Kashan Cumin and also in ISSR primer, the lowest value of similarity was observed (0.085) between Sabzvar and Kashan Cumin. Moreover, according to both ISSR and RAPD analysis, the lowest genetic similarity was 0.117 between Sabzvar and Kashan Cumin. The results of this study showed that Sabzevar cumin is recommended as a center of plant diversity on the basis of studied populations and the farthest population to earliest possible crosses and create a variety of genetic diversity were cumin of Sabzevar and Kashan.