ارزيابي تنوع ژنتيكي گندم دوروم ( Triticum turgidum var. durum) با استفاده از نشانگرهاي رتروترانسپوزوني (SSAP)

ارزيابي تنوع ژنتيكي گندم دوروم ( Triticum turgidum var. durum) با استفاده از نشانگرهاي رتروترانسپوزوني (SSAP)

تنوع ژنتيكي گياهان زراعي اصلي همانند گندم دوروم با گذشت زماني كاهش پيدا كرده است. ارزيابي تنوع ژنتيكي در كارايي حفاظت از ژرم پلاسم و كاربرد آن حائز اهميت مي‌باشد. در اين مطالعه 87 ژنوتيپ بومي‌دوروم متعلق به مناطق مختلف ايران و 21 ژنوتيپ خارجي از 10 كشور با استفاده از 10 تركيب آغازگري SSAP ارزيابي شدند. رتروترانسپوزون‌ها توالي‌هاي متحرك در داخل ژنوم مي‌باشند كه از طريق يك RNA حدواسط در داخل ژنوم جابه‌جا مي‌شوند و توزيع بسيار زيلدي در ژنوم دارند به همين دليل در سال‌هاي اخير نشانگرهاي مولكولي براساس آنها طراحي شده است. نشانگرهاي SSAP مورد استفاده در اين تحقيق شامل Tar1،Thv 19،Tagemina، BARE -1 مي‌باشند. تركيب آغازگري Thv19M + ACA در نمونه‌هاي ايراني و خارجي داراي بيشترين ميزان باند چند شكل(11 باند چند شكل) بود. ميزان چند شكلي مشاهده شده توسط هر كدام از نشانگرهاي بالا در ژنوتيپ‌هاي بومي‌به ترتيب 26/7%، 27/3%، 51/5%، 32/8% و در ژنوتيپ‌هاي خارجي 24/4%، 24/3%، 51/5%،28/5%مي‌باشد. اين نتايج نشان مي‌دهد كه Tar1،Thv19در فرايندهاي تكاملي گياه مورد نظر بيشتر جابه‌جا شده‌اند. دندوگرام بر اساس الگوريتم UPGMA و ضريب تشابه دايس ترسيم شد.

The genetic diversity of major crops, including durum wheat, has suffered an overall reduction with time. The knowledge of patterns of genetic diversity enhances the efficiency of germplasm conservation and improvement. In this study, 87 Iranian landraces of Triticum turgidum var. durum originating from different geographical areas of Iran, along with 21 durum cultivars from ten countries were evaluated using ten primer combination SSAP markers. Retrotransposons are mobile genetic elements that transpose via RNA mediation. They have wide distributions in genome because molecular markers have been designed based on them in recent years. SSAP markers BARE-1,Thv19, Tagermina and Tar1 were also used. Thv19M+ACA primer combination had the most polymorphic band in both landraces and cultivar durum wheats. Approximately 26.7 % BARE-1 bands were polymorphic in landraces.Thv19 showed a polymorphism level of 51.5%, and Tar1 and Tagermina displayed polymorphism levels of 32.8% and 27.2%, respectively. The amount of polymorphism in the studied cultivars for retrotransposons BARE1, Tagermina, Thv19 and Tar1 were 24.4%, 24.3%, 51.5%, 28.5%, respectively. This results show that Thv19 and Tar1 have more transpositional activity in the evolutionary process. Finally, Dendrogram was constructed to use algorithm UPGMA and Dice similarity coefficients.