بررسي فراواني اشريشياكلي انتروپاتوژنيك تيپيكال و آتيپيكال جدا شده از نمونه هاي مدفوع مبتلايان به اسهال بستري در بيمارستان كودكان تهران با روش مولكولي PCR

Evaluation of the prevalence of typical and atypical enteropathogenic Escherichia coli isolated from stool specimens of patients with diarrhea admitted to Tehran Children's Hospital by the PCR Method

سابقه و هدف: بيماري هاي اسهالي عفوني يكي از علل عمده مرگ ومير در جامعه به خصوص در كودكان محسوب مي شوند. سويه هاي اشريشياكلي انتروپاتوژنيك (EPEC)به عنوان عامل عمده اسهال در كودكان به ويژه در كشورهاي درحال توسعه مطرح هستند. هدف از اين مطالعه بررسي فراواني اشريشياكلي انتروپاتوژنيك تيپيكال (tEPEC) و آتيپيكال(aEPEC) جداشده از نمونه هاي بيمارستان كودكان تهران با روش مولكولي PCR مي باشد. مواد و روش ها: در يك مطالعه توصيفي– مقطعي از دي 1395 تا مرداد 1396 تعداد 157 نمونه مدفوع از كودكان مبتلا به اسهال كه به بخش ميكروبيولوژي دانشكده بهداشت دانشگاه علوم پزشكي تهران ارسال شده بود، مورد بررسي قرار گرفت. باكتري هاي اشريشياكلي با استفاده از آزمون هاي بيوشيميايي شناسايي شدند و سپس نمونه ها از لحاظ وجود پاتوتايپ EPEC از طريق PCR با استفاده از شناسايي ژن هاي eae، sxt1 و sxt2 و همچنين وجود سويه هاي تيپيكال و آتيپيكال با استفاده از شناسايي ژن bfp A مورد بررسي قرار گرفتند. الگوي مقاومت چنددارويي EPEC جدا شده با استفاده از روش ديسك ديفيوژن آگار نسبت به آنتي بيوتيك هاي آموكسي سيلين-كلاولانيك اسيد، آمپي سيلين، جنتامايسين، سولفامتوكسازول-تري متوپريم، سيپروفلوكساسين، سفپيم، نيتروفورانتوئين و ايمي پنم مورد ارزيابي قرار گرفت. نتايج: از 101 نمونه اشريشياكلي، 7 سويه EPEC جداسازي گرديد و همه سويه ها داراي ژن eae و فاقد ژن هاي stx2، stx، bfp A و اشريشياكلي انتروپاتوژنيك آتيپيكال بودند. از نظر مقاومت آنتي بيوتيكي، 100 درصد جدايه ها مقاوم به آموكسي سيلين-كلاولانيك اسيد و آمپي سيلين بودند. نتيجه گيري: شيوع بالاي EPEC در كودكان يك تهديد در كشور است. در مطالعه حاضر تمامي ايزوله ها از نوع aEPEC بودند.

Background: Infectious diarrheal diseases are a major cause of death in community, especially in children. Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) are considered as a major cause of children's diarrhea in developing countries. The aim of this study was to evaluate the prevalence of both typical Enteropathogenic (tEPEC) and atypical Enteropathogenic (aEPEC) E. coli isolated from patients admitted to the children's hospital in Tehran by the PCR method. Materials and Methods: In this cross-sectional study, a total of 157 children diarrheal samples were collected from February 2016 to August 2017 and were sent to the microbiology department in the School of Public Health in Tehran University of Medical Sciences for testing. The identification of isolates was performed by conventional biochemical tests. The typical and atypical E. coli isolates were identified for the presence of eae, sxt1, sxt2 genes, and bfp A by the PCR method. The drug resistance patterns of isolated EPEC were tested by the agar disk diffusion method. The antibiotics used were amoxicillinclavulanic, ampicillin, gentamicin, trimethoprim- sulfamethoxazole, ciprofloxacin, cefepim, Nitrofurantoin and imipenem. Results: Out of 101 E. coli isolates, 7 were identified as EPEC. All the isolated strains carried eae but not stx1, stx2, and bfp A genes. Also, 100% of the isolates were resistant to amoxicillin-clavulanic and ampicillin. Conclusion: A high prevalence of EPEC in children can be considered as a threat to the children's health. In this study, all the isolates were aEPEC.