بررسي تنوع ژنتيكي جدايه‌هاي قارچ شاه صدف (Pleurotus eryngii) با استفاده از نشانگر RAPD

Evaluation of Genetic Diversity in Oyster Mushroom (Pleurotus eryngii) Isolates Using RAPD Marker

به‌منظور تعيين تنوع ژنتيكي جدايه هاي قارچ شاه صدفPleurotus eryngii) 45) جدايه قارچ از 10 منطقه مختلف آب و هوايي ايران (استان هاي: اصفهان، چهارمحال و بختياري، كهكيلويه و بويراحمد، لرستان و فارس) جمع‌آوري شد. جهت تعيين تنوع ژنتيكي از نشانگر مولكوليRAPD استفاده شد و به‌كمك 10 آغازگر تصادفي و پس از واكنش PCR و انجام الكتروفورز ژل آگارز، 182 مكان ژني قابل رؤيت مشخص شدند كه در ميان آنها 150 مكان ژني (82%) چند شكلي خوبي را در تمام جدايه ها نشان دادند. جدايه هايي كه داراي ميزبان هاي Ferula assa-foetida و Ferula ovina و Prangus ferulacea بودند، در گروه هاي مجزا قرار گرفتند. همان‌طور كه انتظار مي‌رفت، نقش منطقه جغرافيايي (از نظر دما و ميزان بارندگي) در قرابت ژنتيكي جدايه ها داراي اهميت بود. 71/33 درصد تنوع ژنتيكي درون جمعيت ها و 28/67 درصد تنوع ژنتيكي در بين جمعيت-ها وجود داشت. نتايج نشان داد كه خصوصيات ريخت‌شناختي نمي تواند دسته بندي مناسبي از جدايه هاي P. eryngii بر اساس گياهان هم‌زيست و مناطق جغرافيايي آنها ارائه دهد و براي نيل به اين هدف، استفاده از الگوي RAPD روش سريع و نسبتا"قابل قبولي به‌حساب مي آيد.

In this study, 45 Pleurotus isolates with a wide range of geographical origins (in five provinces of Iran: Isfahan, Chaharmahal Bakhtiary, Kohkiloye boyrahmad, Lorestan and Fars) were collected. A random amplified polymorphic DNA polymerase chain reaction (RAPD-PCR) was used to assess the genetic diversity in ten populations of the Pleurotus eryngii complex. The use of ten primers allowed the production of 150 polymorphic bands. In addition, the evalution of the principal ecological and morphological characters provided further evidence for discriminating between populations. The results show a higher level of diversity of RAPD polymorphism in the populations. 28.67% of the RAPD diversity was among populations and 71.33% was within populations. In the RAPD patterns, Pleurotus strains growing on Ferula assa-foetida, Ferula ovina and Prangus ferulacea formed distinct groups. In this study, the resolution of the RAPD-PCR analysis was better than the morphological analysis.