بررسي و مقايسه ژنتيكي مايكوباكتريوم پاراتوبركلوزيس جدا شده از دام‌هاي استان‌هاي تهران و البرز توسط روش‌هاي PCR و SSR

Review and compare Mycobacterium paratuberculosis isolated from livestock in the provinces of Tehran and Alborz by PCR, SSR methods

سابقه و هدف: مايكوباكتريوم اويوم تحت گونه پاراتوبركلوزيس(MAP) عامل بيماري يون است. اين بيماري گستره جهاني داشته و از لحاظ ايجاد خسارت اقتصادي به صنعت دامپروري از اهميت زيادي برخوردار است. مواد و روش ­ها :اين مطالعه بر روي 30 جدايه كه از لحاظ موقعيت جغرافيايي منطقه جداسازي (استان ­هاي تهران و البرز) و هم­چنين ميزبان (گاو،گوسفند و بز) متفاوت بودند، اجرا گرديد. از روش PCR جهت تكثير دو لوكوس SSR1 و SSR2 استفاده شد. يافته­ ها: نتايج مطالعه حاضر نشان داد كه جدايه ­هاي مورد بررسي از نظر ساختار دو لوكوسSSR1 و SSR2 هم با يكديگر و هم با سويه­ هاي استاندارد داراي تفاوت ژنتيكي است. در اين لوكوس ­ها به­ علت وجود Insertion و يا Deletion توالي­ هاي تكرار شده پشت سر هم، الگوهاي ژنتيكي متفاوتي مشاهده مي­ شود كه امكان تمايز بين سويه­ ها را ميسر مي­ سازد. نتيجه ­گيري: با در نظر گرفتن دو آلل مربوط به هر كدام از ژن­ ها، باكتري­ هاي مورد مطالعه در دو تيپ ژنتيكي جاي گرفتند.

Aim and Background: Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) is causative agent of Johne's disease. The disease is worldwide spread and causes important economic losses in livestock industries. Materials and Methods: This study was performed on 30 bacterial isolates that different by geographical area (provinces of Tehran and Alborez) and host (cattle, sheep and goat). PCR method was used for amplification of two locos SSR1 and SSR2. Results: The results showed that isolates have different structurally based on SSR1and SSR2 each other and also with the standard strain. The locus of Insertion and Deletion due to repetitive sequences in tandem, different genetic patterns observed that the ability to distinguish between strains provides. Conclusion: Considering the two alleles of each gene, genetic samples were placed in two types.