رديابي كموتيپ فومونيزين توليد شده توسط قارچ فوزاريوم پروليفراتوم جدا شده از آجيل در عراق با استفاده از روش پي سي آر اختصاصي

Detection of fumonisin chemotype produced by Fusarium proliferatum isolated from nuts in Iraq using specific PCR assays

مقدمه: پژوهش حاضر به منظور ارزيابي وقوع جدايه هاي قارچ فوزاريوم پروليفراتوم توليدكننده مايكوتوكسين در آجيل در عراق انجام شد. مواد و روش ها: در اين پژوهش 108 نمونه آجيل از فروشگاه هاي مختلف در عراق جمع آوري شد. ويژگي هاي ريخت شناسي گونه هاي فوزاريوم با استفاده از محيط كشت هاي برگ ميخك - آگار و عصاره سيب زميني - دكستروز - آگار بررسي شد. جدايه هاي فوزاريوم پروليفراتوم با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي PRO1/PRO2 تاييد شد. در اين پژوهش همچنين قابليت توليد زهرابه فومونيزين توسط جدايه هاي فوزاريوم پروليفراتوم با استفاده از آغازگرهاي طراحي شده براي ژن FUM1 (FUM1 F/FUM1 R) بررسي شد. نتايج: در اين تحقيق 28 جدايه قارچ جداسازي شد كه بر اساس بررسي‌هاي ريخت‌شناسي 3 گونه قارچي شناسايي شد كه شامل گونههاي فوزاريوم پروليفراتوم (12)، آسپرژيلوس نايجر (8)، آسپرژيلوس فلاووس (5) و گونه نامشخصي از پنيسليوم (3) بودند. آغازگرهاي اختصاصي PRO1/PRO2، قطعه 585 جفت بازي را در همه جدايه‌هاي فوزاريوم پروليفراتوم را توليد كردند. تكثير قطعه دياناي (183 جفت بازي) ژن FUM1 با استفاده از آغازگرهاي FUM1 F/FUM1 R تقريبا در 42 درصد از جدايه هاي فوزاريوم پروليفراتوم بدست آمد. بحث و نتيجه گيري: از بين 12 جدايه فوزاريوم پروليفراتوم، 5 جدايه (42~) قابليت توليد فومونيزين داشتند. اين پژوهش براي نخستين بار در عراق انجام شد و بر اساس مطالعات مولكولي قابليت جدايه‌هاي گونه مركب فوزاريوم فوجيكوروي (FFSC) ارزيابي شد.

Introduction: The present study was carried out to evaluate the occurrence of toxicogenic Fusarium proliferatum strains isolated from nuts in Iraq. Materials and methods: A total of 108 nut samples collected from different markets in Iraq. Strains of Fusarium spp. isolated from nuts seeds and their morphological characterization of the strains were examined based on their growth on carnation leaf agar (CLA) and potato dextrose agar (PDA). The identification of F. proliferatum isolates were confirmed molecularly using species specific primers of PRO1/PRO2 primers. PCR-based detection of fumonisin-synthesis-pathway gene was also used to determine the potential of F. proliferatum isolates to produce fumonisin using FUM1 gene-based (FUM1 F/FUM1 R) primers. Results: Based on morphological features 28 fungal isolates were obtained from nuts and identified into four species F. proliferatum (12), Aspergillus niger (8), Aspergillus flavus (5), and Penicillium sp. (3). The primers PRO1/PRO2 produced DNA fragments 585 bp in all F. proliferatum strains. PCR assays also showed DNA fragments (183 bp) were amplified in nearly 42% of F. proliferatum strains. Discussion and conclusion: Of 12 tested isolates, 5 isolates (~42%) being fumonisin chemotype. To our knowledge, this is the first report on molecular identification and mycotoxigenic capacity of Fusarium fujikuroi species complex (FFSC) isolated from nuts in Iraq.