شناسايي و آناليز فيلوژنتيكي سويه هاي Vibrio harveyi جداشده از ميگو هاي پرورشي سفيد غربي (Litopenaeus vannamei Boone, 1931) - منطقه تياب-هرمزگان

Molecular identification and phylogenetic analysis of Vibrio harveyi strains isolated from Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei Boone, 1931) in Tiab region, Hormozgan province

در مطالعه حاضر باكتري‌هاي Vibrio harveyi از هپاتوپانكراس ميگوهاي پرورشي سفيد غربي Litopenaeus vannamei جمع آوري شده از منطقه تياب جداسازي و شناسايي گرديدند. نمونه هاي ميگو از دو مزرعه شامل 5 استخر در سايت‌هاي تياب شمالي و جنوبي جمع آوري شدند. مرحله جداسازي با رقيق سازي و تلقيح نمونه هاي هپاتوپانكراس با استفاده از محيط تيوسولفات سيترات بايل سوكروز آگار انجام گرفت. پس از خالص سازي، شناسايي فنوتيپي ايزوله هاي به دست آمده بر اساس خصوصيات مورفولوژيك، بيوشيميايي و فيزيولوژيك انجام شد. به دنبال آن 5 سويه منتخب Vibrio harveyi پس از استخراج DNA و تكثير ژن 16S rRNA مورد شناسايي ژنتيكي قرار گرفتند. مقايسه توالي ژن 16S rRNA تكثير شده از جدايه هاي منتخب با توالي هاي ثبت شده در بانك ژن NCBI با استفاده از نرم افزار Megablast ضمن تاييد تعلق سويه هاي جدا شده به Vibrio harveyi بيانگر تشابه بالاي سويه هاي جدا شده با سويه Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 بود. مطالعات آناليز فيلوژنتيك با استفاده از نرم افزار MEGA6بر اساس روش Joining Neighbour نشان داد سويه هاي مورد بررسي داراي منشا منوفيلتيك يكساني بودند. نتايج اين مطالعه حضور گونه هاي Vibrio harveyi در هپاتوپانكراس ميگوهاي پرورشي سفيد غربي منطقه تياب را تاييد نمود.

In this research Vibrio harveyi strains were isolated and identified from hepatopancreas of Litopenaeus vannamei from Tiab region, Hormozgan province. Shrimps samples were collected from five different ponds in northern and southern Tiab shrimp culture sites. Isolation phase was performed by dilution and inoculation of hepatopancreas samples on thiosulfate citrate bile salts sucrose agar medium. Purified isolates were identified phenotypically based on morphological, biochemical and physiological methods. Genomic DNA of five selected Vibrio harveyi strains were extracted and their 16S rRNA genes were amplified. Comparison of amplified 1000 bp sequence of 16srRNA genes with registered sequences in NCBI gene bank by megablast software exhibited high homology between isolated strains and Vibrio harveyi ATCC BAA-1116. Phylogenetic analysis by MEGA 6 sofware based on neighbour Joining method showed that isolated strains had similar monophyletic origin. According to these results presence of V. harveyi strains in hepatopancreas of Litopenaeus vannamei from Tiab region were genetically confirmed.