استفاده از ژن پرآزاري سيرينگومايسين در گروه‌بندي جدايه‌هايPseudomonas syringae pv. syringae عامل شانكر درختان زردآلو و بادام

Virulence-related syringomycin gene in grouping of Pseudomonas syringae pv. syringae strains, the causal agent of canker on apricot and almond trees

در سال ­هاي اخير با توجه به گسترش بيماري شانكر درختان زردآلو و بادام مشكوك به آلودگي با عامل Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) در استان آذربايجان­ شرقي، جهت رديابي و شناسايي برخي از خصوصيات فنوتيپي و ژنوتيپي جدايه­ هاي بيمارگر Pss، نمونه­برداري از 13 منطقه مختلف جغرافيايي استان انجام شد. از نمونه ­هاي مشكوك با علايم ظاهري شانكر، تعداد 14 جدايه باكتري گرم منفي و توليدكننده رنگدانه فلورسنت، بر اساس آزمون­ هاي بيوشيميايي و افتراقي LOPAT و GATTa به عنوان Pss شناسايي شدند. جدايه­ ها اختلاف بسيار جزيي در آزمون­ هاي مورفولوژيكي، بيوشيميايي و فيزيولوژيكي نشان دادند. تعيين ترادف بخشي از ناحيه ژني rpoD، نتايج آزمون ­هاي مورفولوژيكي و فنوتيپي را تاييد نمود. جدايه­ ها تفاوت معني­ داري در مهار رشد رويشي پرگنه قارچ Geotrichum candidum با توليد زهرابه داشتند. در تمامي جدايه­هاي Pss قطعه 725 جفت­بازي ژن syrB دخيل در سنتز زهرابه سيرينگومايسين رديابي گرديد. جدايه­ها بر اساس آزمون بيماري­زايي روي سرشاخه ­هاي بريده زردآلو به دو گروه پرآزار و كم­ آزار تقسيم شدند. تعيين ترادف بخشي از ژن syrB و رسم تبارنما با روش بايزين نشان داد كه در ميان ده جدايه مورد بررسي تنوع ژنتيكي وجود داشته و جدايه­ ها به دو گروه كاملا متمايز تقسيم شدند. گروه­ بندي حاصله با گروه ­بندي به­ دست آمده بر اساس تعيين ترادف بخشي از ژن خانه­دار rpoD مشابهت داشت.

In recent years, due to the increase in canker symptoms on almond and apricot trees suspected to Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) strains in East Azerbaijan province, detection and determination of some phenotypic characters and genetic characterizations of Pss strains were performed after sampling from 13 different geographical regions. A total of 14 Gram negative and fluorescent producing bacterial strains isolated from apparently diseased samples were identified as Pss based on biochemical and differential LOPAT and GATTa tests. Strains showed slight differentiation in morphological, biochemical and physiological tests. Partial sequences of the rpoD gene confirmed the results of the morphological and phenotypical tests. Pss strains had significant differences in regard to inhibition of Geotrichum candidum mycelial growth by toxin production. A 725-bp fragment of the syrB gene required for synthesisof syringomycin was amplified in all Pss strains. Based on pathogenicity tests on apricot twigs, strains were divided into two groups, one of higher and one of lower virulence. Partial sequences of the syrB gene and constructing a dendrogram using Bayesian inference showed genetic diversity among ten studied strains and divided them into two main groups.This grouping was similar to strains’ grouping based on partial sequences of the rpoD gene.