شناسايي نشانگرهاي SNP مشترك مؤثر بر صفات وزن بدن و برخي قطعات لاشه در بلدرچين ژاپني

Identification of Common Effective SNP Markers for Body Weight and Some Cut- Up Carcass Traits in Japanese Quail

هدف از اين مطالعه بررسي نشانگرهاي چند شكلي تك نوكلئوتيدي (SNP) مشترك مؤثر بر صفات وزن بدن در دو و چهار هفتگي، وزن سينه و لاشه (كشتار شده در چهار هفتگي) بود. بدين منظور از داده ­هاي فنوتيپي 105 قطعه بلدرچين و 12798 نشانگر SNP استفاده شد. همبستگي فنوتيپي بين صفات مورد نظر با استفاده از مدل چهار صفتي برآورد شد به گونه ­اي كه اثرات جنس و هچ به‌عنوان اثرات ثابت در نظر گرفته شدند. هم‌چنين روش تابعيت تك نشانگري براي برآورد اثر هر نشانگر براي صفات مورد نظر به كار گرفته شد. نتايج نشان داد كه اثر جنس و هچ بر چهار صفت مورد مطالعه معني­دار بود (p < 0.0001). بيش‌ترين همبستگي بين وزن چهار هفتگي و وزن لاشه برآورد گرديد (0/96). تعداد SNPهاي مشترك موثر بر چهار صفت مذكور 3 و 36 عدد به‌ترتيب در سطوح معني‌داري 1 و 5 درصد به‌دست آمدند. با توجه به همبستگي بالاي بين صفات مورد بررسي، احتمالاً SNPهاي مؤثر مشترك در بين چهار صفت بر روي ژن‌هاي كنترل‌كننده اين صفات و يا در نزديكي آن‌ها قرار گرفته҅ اند.

The objective of this study was to investigate common effective single nucleotide polymorphism (SNP) on two and four week body weight, breast and carcass weights traits (slaughtered at 28 days of age) in Japanese quail. For this purpose, phenotypic data of 105 birds and 12798 SNPs were used. Phenotypic correlation among the interested traits were estimated using a multiple (four) trait model, such that the effects of sex and hatch were considered as a fixed effects. Also, a single marker regression method was applied to estimated marker (SNP) effect for each traits. The results showed that the effect of sex and hatch on the interested traits were significant (p < 0.0001). The highest correlation was estimated between four week body weight and carcass weight (0.96). The number of common effective SNPs were 3 and 36 for 1% and 5% significant levels, respectively. Due to the high correlation among these traits, probably common effective SNPs are located on or near the genes controlling these traits.