استفاده از نشانگر مولكولي rep-PCR در بررسي تنوع ژنتيكي باكتري Ralstonia solanacearum مولد پژمردگي باكتريايي سيب‌زميني در استان كرمان

Genetic Diversity of Ralstonia solanacearum Infecting Potato in Kerman Province Using rep-PCR Analysis

باكتري Ralstonia solanacearum قادر است بالغ DNA بر 30 خانواده مختلف گياهي اعم از گياهان زراعي و وحشي شامل سيب‌زميني، توتون، گوجه‌فرنگي، بادنجان و بادام زميني را آلوده نمايد. يكي از بيماري­هاي مهم سيب‌زميني پژمردگي باكتريايي مي‌باشد كه در اثر باكتري Ralstonia solanacearum به‌وجود مي ­آيد. با استفاده از محيط‌كشت TTC از ساقه‌هاي پژمرده ارقام مختلف سيب‌زميني جمع‌آوري شده از مناطق عمده سيب‌زميني‌كاري استان كرمان شامل جيرفت، ساردوئيه، لاله‌زار و صوغان تعدادي استرين از باكتري Ralstonia solanacearum جداسازي، سپس اين استرين‌ها با استفاده از آزمون‌هاي بيوشيمياي تعيين بيووار و بيماري‌زايي آنها بر روي گوجه‌فرنگي رقم Red Cloud ثابت شد. پس از آن با استفاده از آغازگرهاي BOX، ERIC و REP تنوع ژنتيكي استرين‌ها با روش واكنش‌هاي زنجيره‌اي پلي‌مراز بررسي گرديد. براساس درخت فيلوژنتيكي ترسيم شده با نرم‌افزار NTSYSpc2.0، استرين‌ها در دو گروه ژنتيكـي قرار گرفتند كه در بيـن استـرين‌هاي هر گـروه نيز تنوع مشـاهده شد. به احتمال زياد وجود تنوع ژنتيكي باكتـري R. solanacearum در مناطق سيب‌زميني‌كاري استان كرمان ناشي از ورود غده‌هاي بذري آلوده از ساير منابع آلوده به اين استان است.

Ralstonia solanacearum affects more than 30 plant families, including crops and wild species. Highly susceptiblecrops are potato, tobacco, tomato, eggplant and peanut. Bacterial wilt, caused by Ralstonia solanacearum, is one of the most important diseases of potato (Solanum tuberosum) in world. Strains of Ralstonia solanacearum were isolated from the wilted stems of potato cultivars from the major poato-growing areas, Jiroft, Sardueyeh and Soghan in Kerman province, using TTC medium. The strains were differentiated into biovars using biochemical tests and their pathogenicity was confirmed on tomato Cv. Red Cloud. Possible genetic diversity of R. solanacearum strains recovered from different areas was evaluated by rep-PCR, using REP, ERIC and BOX primers. A phylogenetic tree generated by NTSYS-pc2.0 software placed the strains into two major clusters, with some variations within each cluster. The genetic diversity of R. solanacearum strains infecting potato in Kerman province has probably arisen from the importation of latently infected seed tubers.