بررسي تنوع ژنتيكي چهار نژاد از گوسفندان موجود در ايران با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره‌اي

Genetic Diversity Analysis of Four Sheep Breeds Existing in Iran Using Microsatellite Markers

با توجه به اهميت شناسايي و حفظ تنوع ذخاير ژنتيكي كشور، چهار جمعيت از نژادهاي گوسفند موجود در ايران (پاكستاني (25 رأس)، كرماني (102 رأس)، ايران‌بلك (44 رأس) و لري‌بختياري (25 رأس)) با استفاده از 4 نشانگر ريزماهواره‌اي (McMA2، HSC، OarHH35 و BM6444) از نظر تنوع ژنتيكي بررسي شدند. استخراج DNA ژنومي از تعداد 196 نمونه خون به روش نمكي بهينه ‌شده، انجام شد و واكنش‌هاي PCR با استفاده از چهار جفت آغازگر اجرا شد. نتايج نشان داد كه تمامي جايگاه‌ها چندشكل هستند. تعادل هاردي- واينبرگ به روش آزمون مربع كاي نشان داد كه برخي تركيبات مختلف جايگاه‌ها- جمعيت در حالت عدم تعادل قرار داشتند (0/05>P). بيش‌ترين تعداد آلل مشاهده ‌شده مربوط به جايگاه HSC در جمعيت پاكستاني (14 آلل) و كم‌ترين تعداد نيز از آن جايگاه HSC در جمعيت‌هاي كرماني و ايران‌بلك (7 آلل) بود. حداكثر محتواي اطلاعات چندشكلي (PIC) در حالت تركيب جمعيت- جايگاه براي جايگاه‌هاي McMA2، HSC، OarHH35 و BM6444 به‌ترتيب 0/9، 0/87، 0/87 و 0/86 بودند. در مجموع مي‌توان نتيجه گرفت كه جمعيت‌هاي گوسفند مورد بررسي در اين تحقيق با توجه به جايگاه‌هاي مورد مطالعه، از تنوع ژنتيكي نسبتاً بالايي برخوردارند.

Considering the importance of identification and maintaining of genetic diversity in native animals, four sheep breeds existing in Iran (Pakistani (25), Kermani (102), Iran Black (44) and Lory-Bakhtiyari (25)) were evaluated in terms of genetic diversity, using four microsatellite markers McMA2, HSC, OarHH35 and BM6444. Genomic DNA was extracted from 196 blood samples by optimized salting-out DNA extraction procedure and PCR was performed using four primer pairs. The results showed that all loci are polymorph. Hardy-Weinberg equilibrium using chi-square test showed that some of the various components of loci - population were in Hardy-Weinberg disequilibrium (P<0.05). The highest number of alleles were observed for HSC of Pakistani population (14 alleles) and the lowest number of alleles were in HSC in Kermani and IranBlack populations (7 alleles). The polymorphic information content (PIC) of McMA2, HSC, OarHH35 and BM6444 were 0.9, 0.87, 0.87 and 0.86 respectively. In general, it can be concluded that all studied sheep populations have wide genetic diversity based on studied loci.