شناسايي سروتايپ هاي سالمونلا در طغيان هاي غذايي با استفاده از سكانس ناحيه ي ITS ژن 16S-23S rRNA

Identification of Salmonella serotypes in foodborne outbreaks by sequencing of ITS region of 16S-23SrRNA

زمينه و هدف: بيماري هاي منتقله از غذا يكي از مشكلات جامعه ي امروزي است. در بسياري نقاط جهان˓ بررسي هاي اپيدميولوژي نشان داده است كه عفونت هاي ناشي از سرووارهاي سالمونلا افزايش يافته است. بدين منظور شناسايي سويه هاي سالمونلا در سطح سرووار از اهميت خاصي برخوردار است. ظهور سويه هاي مقاوم در اين سرووارها به يك نگراني جهاني تبديل شده است، بنابراين آگاهي از الگوي مقاومتي در سالمونلاها مي تواند به درمان بيماري هاي منتقله از غذا ناشي از اين سرووارها كمك كند. هدف از اين مطالعه شناسايي سرووارهاي سالمونلا در طغيان هاي غذايي با توالي منطقه اي ITS به روش 16S-23SrRNA مي باشد. روش بررسي: اين مطالعه از نوع توصيفي- مقطعي كه طي يك سال 173 طغيان غذايي كشوري از استان هاي مختلف كشور جمع آوري گرديد. در مجموع 614 نمونه اسهال از نظر وجود سالمونلا بررسي شد. جهت جداسازي و تعيين مقاومت آنتي بيوتيكي اين ايزوله ها از روش هاي استاندارد استفاده گرديد، همچنين براي تعيين سويه هاي سالمونلا از روش مولكولي 16srRNA استفاده گرديد. يافته ها: از ميان 18 ايزوله سالمونلا جدا شده از طغيان هاي رخ داده، 16 ايزوله سالمونلا انتريتيديس (88/9%) و 2 ايزوله پاراتيفي (A (11/1% بود. همگي اين ايزوله ها به آنتي بيوتيك سفتازيديم حساس بودند. بيش ترين مقاومت نيز به ناليديكسيك اسيد (14 نمونه و 77/8 %) بود. نتيجه گيري: شيوع مقاومت آنتي بيوتيك باكتري ها كه تهديد عمده اي براي سلامت انسان است، به سرعت در حال افزايش است. مقاومت آنتي بيوتيكي سويه هاي سالمونلا نيز در حال افزايش است، بنابراين آگاهي از الگوي مقاومت آنتي بيوتيكي سرووارهاي سالمونلا، در درمان ناشي از عفونت هاي اين باكتري در مواد غذايي كمك خواهد كرد.

Background and aim: Foodborne diseases are a major problem of modern society. The epidemiological investigations in many parts of the world had been shown that infections caused by Salmonella serovars are increasing. Therefore, the identification of Salmonella species to serovars level is in specific importance. In addition, the emergence of drug resistance among these serovars also has become a major global concern. So, the knowledge of the resistance patterns of Salmonella could be very useful for the treatment of such foodborne diseases. The aim of this study was to determine Salmonella serotypes in foodborne outbreaks by sequencing of ITS region of 16S-23SrRNA gene. Methods: This was a cross- sectional study, in total, 173 outbreaks in different provinces of Iran during one year were selected. In total, 614 diarrheal specimens from patients in outbreaks were tested for the isolation of Salmonella. Identification of Salmonella was carried out by 16SrRNA method and antibiotic susceptibility was performed by standard methods. Results: Of 18 Salmonella isolated from happened outbreaks, 16 cases (88.9%) were Salmonella enteridis and 2 cases (11.1%) Salmonella paratyphi A, respectively. All isolates were sensitive to ceftazidime, and high resistance to tested antibiotics was seen with nalidixic acid (77.8%) in 14 samples. Conclusion: Prevalence of antibiotics resistance bacteria which is major threat for human health is increasing rapidly. Antibiotic resistance of Salmonella strains also are increasing. Therefore, knowledge of antibiotic resistance pattern to Salmonella serovars will help in treatment of foodborne due to Salmonella infections.