بررسي بيان RNA ي غير كد كننده ي بلند Hottip (lncRNA) در رده ي سلولي B16F10 ملانوماي موشي

Evaluation of the expression of Hottip long noncoding RNA in the B16F10 murine melanoma cell line

زمينه و هدف: ملانوما يكي از انواع سرطان پوست است كه نسبت به ساير سرطان هاي پوست خطرناك تر مي باشد. يكي از عوامل موثر در ايجاد سرطان ها، گروهي از RNA هاي غير كد كننده اند كه به نام lncRNA (long noncoding RNA) شناخته مي شوند. اين مولكول هاي غير كد كننده بيش از 200 باز طول دارند و به عنوان يك تنظيم كننده در پيشرفت سرطان عمل مي كنند (Hottip (HOXA transcript at the distal tip يك lncRNA ي بين ژني است كه از انتهاي '5 لوكوس Hoxa رونويسي مي شود و ژن هاي انتهاي '5 اين لوكوس را فعال مي كند. هدف از اين مطالعه، بررسي ميزان بيان اين مولكول RNA در رده ي سلولي B16F10 ملانوماي موشي بود. روش بررسي: در اين مطالعه بيان ژن Hottip با انجام تكنيك RT-PCR به صورت كيفي روي رده ي سلولي B16F10 ملانوماي موشي بررسي شد. بدين منظور، از رده ي سلولي، RNA كل استخراج و سنتز cDNA انجام گرفت. با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي طراحي شده، ژن هاي Hottip و β2m تكثير گرديدند. يافته ها: نتيجه مطالعه حاضر نشان دهنده ي عدم بيان ژن Hottip موشي در رده ي سلولي B16F10 ملانوماي موشي است. نتيجه گيري: در حالي كه بر اساس مطالعات صورت گرفته در سرطان هاي انساني انتظار مي رفت Hottip افزايش بيان داشته باشد، Hottip موشي در رده ي سلولي B16F10 ملانوماي موشي بياني نشان نداد.

Background and aims: Melanoma is the most dangerous form of skin cancer. One of the remarkable cancer- causing factors is non-coding RNAs including lncRNAs (long noncoding RNA). lncRNAs have more than 200 bases and act as a key regulator of cancer progression. HOTTIP (HOXA transcript at the distal tip) is an intergenic lncRNA that is transcribed from the 5' end of the HOXA locus and activates the genes of the 5' end of this locus. The aim of this study was to evaluate the expression of this lncRNA in the B16F10 murine melanoma cell line. Methods: In this study, the expression of Hottip gene was studied on B16F10 murine melanoma cell line using qualitative RT-PCR. Total RNA was extracted and cDNA was synthesized. Hottip and β2m genes were amplified using designed specific primers. Results: The result showed that Hottip did not express in the B16F10 murine melanoma cell line. Conclusion: In contrast to the previous studies revealing increased expression of HOTTIP in human cancers, murine Hottip does not express in the B16F10 murine melanoma cell line.