اثر واريانس ژنتيكي QTL بر صحت ارزيابي ژنومي در حالت انتخاب و عدم انتخاب در جمعيت مرجع

The effect of QTL genetic varience on the accuracy of genomic evaluation with selection and without selection in refrence population

به انتخاب براساس ارزش¬هاي ارثي ژنومي (GEBV)، انتخاب ژنومي گويند. هدف از اين تحقيق بررسي صحت ارزيابي ژنومي در شرايط عدم انتخاب و انتخاب در جمعيت مرجع، در سطوح مختلف سهم QTL از واريانس ژنتيكي افزايشي و وراثت¬پذيري بود. در اين تحقيق ژنومي متشكل از 1 كروموزوم به طول 100 سانتي¬مورگان، به منظور بررسي صحت ارزيابي شبيه¬سازي شد. جمعيت پايه مركب از500 نر و 500 ماده بود و 1000 نسل آميزش تصادفي بين آنان صورت گرفت. از نسل 1000 تا نسل 1150 اندازه جمعيت كاهش يافت و به 300 فرد رسيد. سپس طي صد نسل بعد، در سناريوي اول تعداد افراد جمعيت به 600 حيوان و در سناريوي دوم تعداد افراد جمعيت به 1200 حيوان افزايش يافت. در سناريوي اول حيوانات تصادفي انتخاب شدند و در سناريوي دوم انتخاب براساس روش BLUPدر جمعيت مرجع انجام شد اما در جمعيت تأييد هيچ¬گونه انتخابي اعمال نشد. نتايج اين تحقيق نشان داد كه اعمال انتخاب سبب كاهش صحت ارزيابي ژنومي در جمعيت تأييدي كه در آن آميزش تصادفي صورت مي¬گيرد، مي¬شود. به اين ترتيب كه در سطح وراثت¬پذيري 5/0 و سهم QTL 100% در حالت بدون انتخاب صحت جمعيت تأييد (03/0±)91/0 بود و در حالت انتخاب ميزان صحت در همين سطوح 34/0 كاهش يافته است.

Selection based on genomic estimated breeding values (GEBV), called Genomic selection. The purpose of current research was to investigate the accuracy of genomic evaluation, while no selection and selection in refrence population, at various levels of QTL genetic varience. In this research a genome consisted of one choromosome of 100 cM length, was simulated for investigating the accuracy of genomic evaluation. The base population was consisted of 500 males and 500 females and random mating was done over 1000 generations. From generation 1000 to generation 1150, the population size was decreased to 300. Then during 100 generations, the number of individuals increased to 600 animals in the first scenario and 1200 animals in second scenario. In the first scenario animals selected randomly and in second scenario selection was conducted based on BLUP method in reference population but no selection on candidate population. Every scenario was performed by 10 replications. The result of this research showed that selection is the cause of decreasing accuracy of genomic evaluation in candidate population, while random mating was done. The accuracy of candidate population was 0.91(±0.03) without any selection at level of heritability 0.5 and QTL contribution 100% and when selection was conducted the accuracy in same levels decreased 0.34 .