الگوي متيلاسيون ژن OGG1 در سرطان معده

سرطان معده، يكي از تومور‌هاي بدخيم دستگاه گوارش و با عوارض بالا است كه از لحاظ فراواني چهارمين سرطان و دومين عامل مرگ مرتبط با سرطان است. سرطان‌ها از جهش‌هاي ژني و/‌يا بيان ژني تغييريافته ايجاد مي‌شوند كه سرانجام باعث اختلال در نظم تعدادي پروتئين و RNAهاي غير‌كدكننده مي‌شوند. تغييرات در بيان ژن فقط با فاكتورهاي ژنتيكي و محيطي ايجاد نمي‌شود، بلكه توسط فاكتورهاي اپي‌ژنتيكي هم رخ مي‌دهد كه قابل توارث بوده و تغييرات غيرژنتيكي اجزاي كروموزوم هستند. متيلاسيون DNA، بعنوان يك فاكتور اپي‌ژنتيكي، نقش مهمي را در تنظيم بيان ژن ايفا مي‌كند و متيلاسيون نابجا بطور بالقوه‌ تعدادي از فرم‌هاي سرطان‌ را پيش‌بيني مي‌كند. جزاير CpG، نواحي غني از CpG به طول 200 جفت‌باز تا چندين كيلوباز هستند كه معمولا در نزديكي پروموتر ژنهاي با بيان بالا قرار دارند و مكان‌هاي رايج متيلاسيون در تومورهاي انساني هستند. يك ويژگي متداول مرتبط با تومورزايي، هايپرمتيلاسيون سيتوزين‌هاي 5 به گوانين‌هاي درون ناحيه تنظيمي ژن است. در تومورها تعداد زيادي از جزاير CpG هايپرمتيلاسيون نابجا را نشان مي‌دهند كه منجر به خاموشي ژن مي‌شود. استرس اكسيداتيو (OS) كه تحت استرس‌هاي محيطي توليد مي‌شود مي‌تواند به نوبه‌ي خود مكانيسم‌هاي تومورزايي مختلفي را القا كند. بيشتر آسيب‌هاي اكسيداتيو DNA توسط پروتئين‌هاي سيستم ترميم حذف باز شامل 8- اكسوگوانين-DNA گليكوزيلاز 1(OGG1) ترميم مي‌شود. متيلاسيون نابجاي ژنهاي OS مي‌تواند با تغيير‌دادن مسيرهاي وابسته به OS و توسعه‌ي سرطان به تومورزايي كمك كند. لذا هدف از اين مطالعه تعيين وضعيت متيلاسيون ژن OGG1 در سلول‌هاي سرطاني معده بود. براي دستيابي به اين هدف DNA ژنومي از بافت معده‌ي 15 بيمار و 20 فرد سالم استخراج شد. جهت تبديل سيتوزين به يوراسيل تيمار با سديم بي‌سولفيت صورت گرفت. جزاير CpG ژن OGG1 توسط نرم افزار تحت وب Methprimer پيشي‌بيني شد و دو جفت پرايمر (متيله و غيرمتيله) طراحي گرديد.. DNA بيسولفيته با روش MS-PCR تكثير شد. وضعيت متيلاسيون پروموتر اين ژن در همه نمونه‌ها بررسي شد. نتايج اين مطالعه نشان مي‌دهد كه‌ متيلاسيون ژن OGG1 با سرطان معده مرتبط نمي‌باشد. اگرچه جهت تاييد اين نتيجه، نياز به مطالعات وسيع‌تر با تعداد بيشتر نمونه‌هاي بيمار و كنترل مي‌باشد.