مطالعه تاثير اندازه‌ي متفاوت جمعيت مرجع و رابطه‌ي خويشاوندي بر صحت ايمپيوتيشن ژنوتيپ در گاوميش‌هاي ايتاليايي

در اين مطالعه تاثير اندازه‌ي متفاوت جمعيت مرجع و رابطه‌ي خويشاوندي جمعيت آزمون با گروه مرجع با استفاده از روش ايمپيوتيشن FImpute با استفاده از اطلاعات ۹۲۰ راس گاوميش مديترانه‌اي ايتاليايي كه با تراشه‌هاي Axiom Buffalo 90k SNP-Chip تعيين ژنوتايپ شده‌ بودند مورد بررسي قرار گرفت. نشانگرهايي كه داراي فراواني آلل نادر بالايي بودند به عنوان كانديدا براي چيپ كم تراكم 10k انتخاب شدند. تعداد ۴۲، ۷۷، ۲۰۲، ۴۱۲ و ۷۳۲ فرد به عنوان افراد گروه مرجع و حيوانات ۴ نسل اخير شامل ۱۸۳ فرد به عنوان جمعيت آزمون انتخاب شدند. ماتريس رابطه‌ي خويشاوندي آللي براي جمعيت تشكيل شد و رابطه‌ي خويشاوندي افراد جمعيت آزمون با جمعيت مرجع محاسبه شد. نتايج نشان دادكه افزايش اندازه‌ي جمعيت مرجع باعث افزايش صحت ايمپيوتيشن مي‌شود. رابطه‌ي خويشاوندي افراد جمعيت آزمون با جمعيت مرجع صحت ايمپيوتيشن را مخصوصا هنگامي كه اندازه‌ي جمعيت مرجع كم بود بيشتر تحت تاثير قرار داد.