مقايسه ساختار ژنتيكي گاوميش با گاو هلشتاين با استفاده از تراشه هاي SNP

در اين پژوهش با هدف بررسي ساختار ژنتيكي ژنوم گاوميش با گاو هلشتاين از چيپ 50 كي و 777 كي گاوي استفاده شد. تعداد 1089 نمونه اسپرم از گاونر هلشتاين ايتاليا و 384 نمونه خون از گاوميش هاي ماده كشور برزيل تهيه و تعيين ژنوتيپ به ترتيب با استفاده از چيپ 50 كي و 777 كي شركت ايلومينا انجام شد. تصحيح داده ها با Plink انجام گرفت و مقدار پيوستگي نامتعادل با دو پارامتر r2 و Dˊ محاسبه شد. متوسط MAF در كروموزوم هاي مختلف هلشتاين بين 20/ 0 تا 29/ 0 بود و كه از متوسط MAF در گاوميش(13 /0± 14 /0) بيشتر بود. سطح پيوستگي نامتعادل در هر دو گونه با افزايش فاصله بين ماركر ها كاهش يافت. پارامتر r2 در جمعيت گاوميش ها بالاتر از جمعيت هلشتاين بود و اندازه موثر جمعيت در گاوميش نسبت به اندازه موثر جمعيت در هلشتاين كمتر بود، كه نشان دهنده بسته بودن جمعيت و سطح بالاي پرورش خويشاوندي در گاوميش بود. بطور كلي نتايج اين پژوهش نشان داد كه ساختار ژنتيكي دو گونه شباهت زيادي با يكديگر دارد، لذا تراشه هاي SNP كه بيشتر با هدف اصلاح نژاد در گونه گاو طراحي شده اند قابل استفاده در مطالعات ارتباطي وانتخاب ژنومي گاوميش نيز مي باشند.