پيش بيني برهمكنش هاي پروتئين-پروتئين با استفاده از روش PPHGS-SVM

پروتئين ها ماكرومولكول هايي هستند كه در اكثر فرايند هاي درون سلول نقش دارند. از قبيل انتقال، تنظيم هورموني، سوخت و ساز بدن، تنفس و كنترل ژن ها. از طرفي اطلاعات برهم كنش هاي پروتئين-پروتئين كه توسط فناوري هاي آزمايشگاهي با توان عملياتي بالا استخراج مي شوند اغلب ناكاملو نويزي مي باشند. بنابراين گسترش روش هاي محاسباتي و داشتن مجموعه داده هاي برهم كنش با كيفيت بالا، براي پيش بيني برهم كنش هاي پروتئين-پروتئين ضروري است. هدف از اين مقاله ارائه روشي براي بالابردن دقت پيش بيني برهمكنش ها مي باشد. به منظور رسيدن به اين هدف، روش PPHGS-SVM را پيشنهاد داده ايم كه بر روي يك مجموعه داده تجميعي اعمال شده است. بنابراين در اين مقاله، از روش PCA براي كاهش ابعاد مجموعه داده استفاده كرده ايم تا با استخراج ويژگي هاي مهم آن، هم زمان پردازش را كم كنيم و هم دقت پيش بيني را افزايش دهيم. همچنين از روش PHGS به منظور انتخاب مناسب پارامتر ها براي دسته بند SVM بهره برده ايم و توانستيم دقت پيش بيني برهمكنش هاي پروتئين-پروتئين را از 5.17 % به . 5715 %بهبود دهيم. نتايج به دست آمده نشان مي دهد كه روش ارائه شده نسبت به روش هاي قبلي كارايي بهتري دارد