شناسايي miRNAهاي حفاظت¬شده و اختصاصي برنج و بررسي ژن¬هاي هدف آنها با استفاده از آناليز بيوانفورماتيكي

MicroRNA (miRNA)ها يكي از انواع RNA‌هاي كوچك درون‌زاد غيركدكننده پروتئين مي‌باشند كه در تنظيم فرايندهاي گوناگون سلولي نقش دارند. همچنين تحقيقات نشان داده كه miRNAها نقش مهمي در پاسخ به تنش‌هاي محيطي ايفا مي‌كنند. شناسايي miRNAها در گونه‌هاي مختلف در سال‌هاي اخير بسيار مورد توجه قرار گرفته‌است. در اين تحقيق miRNAهاي گياه برنج، به منظور بررسي خصوصيات ساختار ساقه-حلقه، توالي و ژن¬هاي هدف آنها با استفاده از روش¬هاي بيوانفورماتيكي مورد بررسي قرارگرفتند. همچنين مقايسه¬اي بين miRNAهاي برنج با ساير گياهان تك لپه و دولپه به منظور شناسايي miRNAهاي حفاظت¬شده و ژن¬هاي هدف آنها انجام شد. نتايج نشان داد با وجود تنوع فراوان گياهان نسبت به جانوران از نظر طول ساختار ساقه-حلقه، در گياهان نيز طول اكثر miRNAها هم در تك¬لپه¬ها و هم در دولپه¬ها در محدوده مشابهي وجود دارد. همچنين براي برنج و ساير گياهان فراوانترين نوكلئوتيد در انتهاي ´5 مولكول miRNA با طول 20، 21 و22 اوراسيل و براي طول 24 آدنين بود. miRNAهاي اختصاصي و miRNAهاي حفاظت¬شده برنج و ژن¬هاي هدف آنها شناسايي شدند، كه عمده¬ترين ژن¬هاي هدف براي miRNAهاي حفاظت¬شده فاكتورهاي رونويسي بودند.