شماره ركورد كنفرانس :
4723
عنوان مقاله :
نقش ايمپيوتيشن ژنوتيپ و معماري‌هاي مختلف ژنومي بر عملكرد روش‌هاي جنگل تصادفي و بيز آستانه‌اي A
پديدآورندگان :
نادري يوسف yousefnaderi@gmail.com دانشگاه آزاد اسلامي واحد آستارا; , مزارعي محمد دانشگاه آزاد اسلامي واحد آستارا;
كليدواژه :
عدم تعادل پيوستگي , نرخ ژنوتيپ از دست رفته , شبيه سازي
عنوان كنفرانس :
ششمين كنگره ملي علمي پژوهشي توسعه و ترويج علوم كشاورزي و منابع طبيعي ايران
چكيده فارسي :
هدف اين تحقيق بررسي صحت ايمپيوتيشن و تاثير آن در سطح زير منحني مشخصه عملكرد (AUROC) ارزيابي ژنومي روش‌هاي بيز آستانه‌اي A(TBA) و جنگل تصادفي (RF) در صفات آستانه‌اي با معماري هاي مختلف ژنومي مي‌باشد. داده‌هاي ژنومي براي سطوح متفاوت وراثت‌پذيري (1/ 0 و 3/ 0)، سطوح مختلف LD (135/ 0 و 295/ 0) و تعداد متفاوت جايگاه هاي صفات كمي (108 و 1080) بر روي كروموزم 27 كروموزم شبيه‌سازي شدند. براي شبيه سازي شرايط واقعي براي هر سناريو، از بين 54 هزار نشانگر شبيه سازي شده به طور تصادفي اقدام به حذف %50 و %90 نشانگرها نموده و در مرحله بعد از طريق ايمپيوتيشن اقدام به پيش بيني ژنوتيپ نشانگرها نموده و صحت ايمپيوتيشن مورد ارزيابي قرار گرفت. در گام آخر، ژنوتيپ‌هاي اصلي و ايمپيوت شده با استفاده از روش TBA و RF جهت ارزيابي AUROC مورد استفاده قرار گرفتند. با افزايش سطح LD و كاهش نرخ حذف نشانگرها، صحت ايمپيوتيشن بهبود يافت.
