استفاده از نشانگرهاي ساده تكرار شونده در بررسي گروه بندي ژنوتيپ هاي جو ديم

به منظور بررسي تنوع ژنتيكي ژنوتيپ هاي جو ديم، از 14 جفت آغازگرSSR بر روي 20 ژنوتيپ جو استفاده شد. استخراج DNA به روش DART با اندكي تغيير انجامم شد. 14 جفت آغازگر درمجموع 424 باند چند شكل را توليد نمودند. در اين مطالعه متوسط تعداد باند به ازاي هر آغازگر 43/30 عدد و براي هر ژنوتيپ 21/3 عدد بود . بيشترين ميزان اطلاعات چند شكلي(PIC) مربوط به آغازگرهاي Hvm60 و Hvm20 به ترتيب با مقادير 0/88 و 0/73 بود و كمترين مقدار آن مربوط به آغازگر Bmac0032 با مقدار 0/32 بود. ميانگين PIC براي كل آغازگرها 0/6 به دست آمد. با محسابه ضريب تشابه جاكارد، ارزش هاي تشابه بين ژنوتيپ ها دامنه اي از 0/3 تا 0/96 را داشتند. بيشترين تشابه ژنتيكي مربوط به ژنوتيپ هاي شماره6 (رقم زراعي) و شماره 5(لاين اميد بخش ) با 0/96 بود و كمترين تشابه مربوط به شماره 13(پوشينه دار) و شماره 10(پوشينه دار) با 0/3 بود. در اين پژوهش دندروگرام حاصل از تجزيه خوشه اي به روش UPGMA و با استفاده از نرم افزار NTSYS ترسيم شد كه ژنوتيپ هاي مورد مطالعه در 5 گروه اصلي قرار گرفتند. تفكيك براساس داده هاي مولكولي SSR تا حدودي توانست ژنوتيپ هاي دو و شش رديفه و همچنين ژنوتيپ هاي دانه پوشيده و بدون پوشينه را از هم تفكيك نمايد.