مطالعه بيوانفورماتيكي ژن مسئول مقاومت به سفيدك سطحي در لوكوس pm3 در گندم

درگندم؛ مقاومت اخصاصي به پاتوژن قارچ سفيدك سطحي(Bgt) بوسيله ژن هاي pm كنترل مي گردد. تاكنون بيش از 55 ژن Pm در 39 جايگاه ژني در كروموزوم هاي گندم شناسايي شده است. حدود 7 الل ( pm3a-pm3g ) درلوكوس pm3 در بازوي كوتاه كروموزوم 1A گندم هگزاپلوئيد شناسايي گرديد. ارزيابي هم رديفي توالي نوكلئوتيدي و پروتئيني الل هاي ژن pm3 با استفاده از نرم افزار BioEdit حاكي از شباهت بسيار بالاي توالي الل ها بود. بطوريكه در بين آنها، الل هاي pm3a و pm3b بيشترين تفاوت را به ساير الل ها نشان دادند. درخت فيلوژنتيكي ترسيم شده بوسيله نرم افزار MEGA، حاكي از قرارگيري الل هاي a وb و الل f در دو گروه جداگانه و ساير الل ها در زير شاخه جداگانه از اين الل ها بود كه نتايج فاصله ژنتيكي تاييد كننده نتايج فيلوژنتيكي بود. آناليز Coils توالي پروتئيني حاكي از قرار گيري ناحيه CC، بين اسيدآمينه هاي 17 و 58 بود لذا اين الل ها به زير خانواده CC، از پروتئين مقاومت LRR - NBS تعلق دارند. توالي ناحيه LRR در تمامي الل ها به جز الل Pm3C يكسان و حدود 60 اسيد آمينه بود در حاليكه در الل Pm3C طول اين ناحيه حدود 394 اسيد آمينه بود. در حاليكه طول ناحيه NB درتمامي الل ها يكسان و حدود 285 اسيد آمينه بود.