بررسي ترجيح كدوني ژن هاي رمز كننده پروتئين DI در چهار علف هرز

به منظور مقايسه و بررسي ترجيح كردوني ژن هاي رمز كننده پروتئين (Qβ) D1 در علف هاي هرز به عنوان يكي از مهمترين عوامل كاهنده عمكرد گياهان زراعي ، توالي 80 آيزوفرم از چهار علف هرز مختلف از پايگاه اطلاعات NCBI جمع آوري شد و با استفاده از نرم افزار gene infinity ترجيح كدون هاي مختلف اسيد آمينه ها و كدون هاي پايان تجزيه و تحليل شد . نتايج نشان داد كه علف هرز بروموس براي اسيد آمينه ايي كه داراي دو كدون بودند ، اسيد آمينه سيستئين ، فنيل آلانين و لايزين كدون ايي را ترجيح داده اند كه به نوكلوتيد هاي C و G ختم مي شوند . در صورتي كه آسپارتيك اسيد ، گلوتاميك اسيد، هيستسدين ، آسپارژين ، گلوتامين و تيروزين كدون هايي كه به A , T ختم شده اند ترجيح داده شده است . براي اسيد آمينه هاي كه داراي جهار و شش كدون هستند ، كدون هايي كه به A و T ختم شده اند ترجيخ داده مي شود . در عفل هرز فالاريس براي اغلب اسيد آمينه ها يك كدون با درصد بسيار بالا ( بين 80% تا 90% ترجيح داده شده است و در صد ناجيزي از بيان به ديگر كدون ها اختصاص يافته است و در علف هاي هرز تاج خروس و سلمه تره، اغلب اسيد آمينه ها كدون هاي پايان يافته با A و T را جيحح داده اند . در ثصورتي كه سيستئين ، گلايسين ، آسپارژين و تيوزين كدون هايي را ترجيح مي دهند كه به نوكلوتيد Cيا G ختم شده است . بطور كلي در اغلب موارد بين دو گياه پهن برگ و دو گياه باريك براي مورد مقايسه ترجيح كدوني مشابهي براي ژن هاي رمز كننده پروتئن D1 وجود دارد .