مشخصات مولكولي ژنوم كامل جذايه ايراني ويروس بي بذري گوجه فزنگي

اخيرا ويروس بيبذري گوجه فرنگي از گياهان زينتي از استان كرمان گزارش گرديده است . به منظور مطالعه و بررسي مولكولي ژنوم كامل جدايه ايراني ويروس بي بذري گوجه فرنگي بك نمونه گياه اطلسي آلوده به اين ويروس در منطقه ماهان كرمان جمع آوري و آلودگي نسبت به TAV توسط آزمون DAS-ELISA تاييد گرديد . آر . ان .اي اين جدايه استخراج و با استفاده از سيزده جفت آغازگر اختصاصي طولكامل ژنوم اين جدايه در روش RT-PCR تكثير و سپس در پلاسميد pTZ57R/T در دو سويه JM 107 باكتري Escherichia coli همسانه سازي گرديد . بر اساس نتايج حاصل طول قطعات RNA-1، RNA-2 و RNA-3 جدايه ايراني TAV ( Ker.Mah.P) به ترتيب 3357، 3035، 2192 و طول كامل ژنوم اين جدايه معادل 8587 نوكلئوتيد بدست آمد . زنوم اين جدايه حاوي پنج قاب باز خواندني شامل CP، MP ، 2a ، 2b، 1aمي باشد . موتيف هاي حفاظت شده ناحيه هليكاز و نواحي حفاظت شده RdRp به ترتيب بر روي قطعات RNA-1 و RNA-2 قرار دارند . همچنين نواحي حفاظت شده UG tractو نايحه بين زني (IR) نيز بر روي قطعه RNA-3 قرار دارد . در انتهاي 3 UTR تمامي آر . ان . اي هاي جدايه مذكور نيز يك توالي حفاظت شده به طول 40 نوكلئوتيد وجود دارد . علاوه بر اين ژن 2b جدايه Ker.Mah.P نيز به طول 315 نوكلئوتيد بوده كه داراي 27 نوكلئوتيد بيش تر از ساير جدايه هاي گزارش شده TAV در دنيا مي باشد . نتايج خاصل از اين تحقيق بيانگر آنست كه ژنوم جدايه ايراني ويروس TAV همانند ساير جدايه هاي اين ويروس در دنيا داراي نواحي حفاظت شده مي باشد .