بررسي امكان جذب بيلي روبين توسط نانوكلاژن با روش بيوانفورماتيك: معرفي يك نانوجاذب طبيعي براي تشخيص و درمان بيماري زردي نوزادان

Investigating the possibility of bilirubin absorption by nanocollagen using bioinformatics method: Introducing a natural nanoabsorbent for the diagnosis and treatment of neonatal jaundice.

زردي نوزادان يا هايپربيلي‌روبينمي نوزادي به معني زرد شدن رنگ پوست نوزادان بوده و در 60 درصد نوزادان مشاهده مي شود. بيلي‌روبين يكي از پيگمان‌هاي زردرنگ صفراوي است كه از شكست و تجزيه طبيعي هموگلوبين حاصل مي‌شود و عامل رنگ زرد ادرار و رنگ قهوه‌اي مدفوع است. عدم درمان زردي سبب اسيب مغزي و انسفالوپاتي و فلج مغزي و كرنيكتروس مي شود. در طي اين تحقيق امكان جذب بيلي روبين توسط نانوذرات كلاژن، با روش داكينك مولكولي بررسي شد. براي انجام كار نخست فايل مولكول بيلي روبين با پسوند .mol را از ديتابيس Pubchem استخراج و سسپس در نرم افزار Hyperchem فرمت .pdb از آن بدست آمد. در اين نرم افزار بيهنه سازي ساختار نيز انجام و ساختار سه بعدي بهينه شده مورد استفاده قرار گرفت. همچنين ساختار سه بعدي نانوكلاژن نيز از ديتابيس PDB استخراج گرديد و در كامپيوتر ذخيره شد. براي انجام داكينگ مولكولي از سايت HDOCK استفاده و بعد از ارائه فايل pdb از بيلي روبين و نانوكلاژن انرژي داكينگ و RMSD مدل هاي ارائه شده مورد تجزيه تحليل قرار گرفت. اين مطالعه نشان داد امكان اتصال مولكول بيلي روبين روي قسمت هاي مختلف نانوكلاژن وجود داشته و در بهترين جايگاه انرژي داكينگ 129- كيلوكالري بر مول و RMSD حدود 62 آنگستروم بود.