بررسي ايمني‌زايي توالي منتخب از باكتري استرپتوكوكوس آگالاكتيه به منظور توسعه يك dna واكسن عليه ورم پستان گاو

ورم پستان شايعترين و پرهزينه ترين بيماري مرتبط با توليد در گله هاي شيري است. بازده و تركيب شير مي تواند تحت تأثير دوره ي كوتاه مدت اين بيماري قرار بگيرد و در صورت عدم درمان، ورم پستان مي تواند از طريق تأثيرات بلند مدت دوره ي بعدي شيرواري را تحت تأثير قرار دهد. در مطالعه ي حاضر به منظور توسعه ي يك واكسن نوتركيب تحت واحدي، پس از بررسي هاي بيوانفورماتيك و هم‌ترازي، بخش كانزرو توالي (آنتي ژن سطحي ring infected erythrocytes ) fbsa انتخاب شد. اين بخش از اسيدآمينه ۸۹ تا ۲۹۲ پروتئين مورد نظر قرار گرفته است. شاخص‌هاي مختلف فيزيكي-شيميايي پروتئين مانند نقطه ايزوالكتريك، وزن مولكولي، نيمه عمر، تعداد دنباله هاي منفي و مثبت و... بــا اســتفاده از ابزار protparam در پايــگاه expasy (protparam/tools/org.expasy) محاســبه گرديــد. نتيجه رونويسي از توالي منتخب با نرم افزار expasy در فريم ۲ توالي اسيدهاي آمينه مورد نظر را نشان داد. اين امر مشخص مي كند كه بيان كانستراكت، مطابق توالي مورد درخواست خواهد بود و هيچ عدم تطابقي مشاهده نشد حلاليت پروتئين به وسيله prediction solubility protein recombinant (http//:www.biotech.ou.edu) ارزيابي شد. يك پادگن براي اينكه كانديداي خوب واكســن باشــد بايد هيدروفيل بوده و بتواند هر دو پاســخ ايمني با واسطه ياخته-هاي b و t را برانگيزد. پيشگويي ايمني‌زايي هومورال قطعه‌ي منتخب از پروتئين مورد نظر با استفاده از سايت http://sysbio.unl.edu/svmtrip/prediction.php انجام شد. بر اساس نتايج به دست آمده اين پروتئين داراي ۱۰ اپي‌توپ خطي درون خود است و مي‌تواند حداقل انگيزه‌ي توليد ۱۰ آنتي‌بادي باشد. لذا تحريك ايمني هومورال مناسب خواهد بود. پيشگويي ايمني‌زايي سلولي قطعه‌ي منتخب بر اساس امكان عرضه توسط mhc i و mhc ii در گاو با استفاده از آلل-هاي گاوي مناسب و آلل هاي انساني داراي بيشترين شباهت با آلل هاي گاو و همين طور پيشگويي اپي‌توپ‌هاي مورد شناسايي لنفوسيت‌هاي b با استفاده از نرم‌افزار iedb analysis (http://tools.iedb.org/main/) انجام گرديد. ارزيابي ايمني‌زايي براي لنفوسيتهاي b نشان داد حداقل ۲۵ اپي توپ قابل شناسايي توسط اين سلول ها وجود دارد. پيشگويي ايمني‌زايي سلولي قطعه‌ي منتخب از پروتئين fbsa بر اساس آستانه اتصال به mhc i تحت كلاس bola- d ۱۸.۴ نشان داد در ۲۵ جايگاه ۹ واحد اسيدآمينه امكان اتصال آنتي‌ژن در توالي‌هاي مشخص به مولكول mhc i گاو در تحت كلاس bola- d ۱۸.۴ وجود دارد. پيشگويي ايمني‌زايي سلولي قطعه‌ي منتخب از پروتئين مورد نظر بر اساس آستانه اتصال به mhc ii تحت كلاس hla-drb۱*۱۱:۸۹، hla-drb۱*۱۴:۸۲، hla-drb۱*۱۴:۱۴ و hla-drb۱*۱۴:۵۱ نشان داد ۲۳ پپتيد با آستانه‌ي مناسب براي اتصال و عرضه توسط مولكول‌هاي mhc ii آلل هاي معادل گاوي پيشگويي مي‌شود. در مجموع ايمني زايي قطعه ي مورد نظر مناسب تشخيص داده شد