مطالعه بيوانفورماتيكي ژن Catalase در چند گياه مختلف

Bioinformatic investigation of Dehydrin gene in barley and several different plants

كاتالاز به عنوان يكي از مهمترين آنزيم هاي آنتي اكسيداني است كه با تجزيهH2O2 به تعادل گونه هاي اكسيژن فعال كمك كرده و نقش مهمي در در گياهان در مقابل تنش اكسيداتيو به عهده دارد . در اين پژوهش به منظور بررسي و مطالعه ژن كاتالاز، توالي ژنومي ژن كاتالاز در چندين نمونه گياهي مختلف (آرابيدوپسيس تاليانا ، آرابيدوپسيس ليراتا ، برنج ، گندم ، جو ، ذرت ، كلزا ، كلم راپا ، كلم برگ ، سويا ، ماش ،پنبه ، كرچك ، كنجد ، بادام زميني ) از سايت NCBI استخراج و مورد بررسي قرار گرفت. نتايج بيانگر اين بود كه طول ژن كاتالاز از 4496- 2837جفت نوكلئوتيد در گياهان مورد بررسي متغيير بوده است. نتايج هم رديفي نشان داد كه توالي نوكلئوتيدي ژن‌ Cat در گونه‌هاي مورد مطالعه داراي بيش از 75 درصد شباهت و توالي اسيدآمينه آنها داراي بيش از 86 درصد شباهت مي باشد. نقطه ايزوالكتريك بين 7.08- 643/6 متغيير بود و اين پروتئين با فراواني بالا در ناحيه پراكسيزوم قرار دارد. ترسيم درخت فيلوژنتيكي نيز حاكي از قرار گيري گياهان مورد مطالعه در دو گروه مجزا بود.