مرکز منطقه ای اطلاع رساني علوم و فناوري - بررسي نقش خانواده ژني دهيدرين در گياه جو( Hordeum vulgare)

چكيده فارسي :

دهيدرين‏ ها (DHNs) متعلق به گروه دوم پروتئين ‏هاي LEA مي‌باشند كه اعضاي آن در اواخر دوره جنين‏ زايي در بذر و در پاسخ به تنش‏ هاي غيرزيستي مانند شوري، خشكي و سرما در بافت رويشي تجمع مي‏ يابند. در اين مطالعه، 13 ژن كدكننده پروتئين دهيدرين (DHN) در ژنوم جو( Hordeum vulgare) شناسايي و خصوصيات فيزيك وشيميايي، جايگاه سلولي، موتيف‌هاي حفاظت‌شده و ساختار ژني آن‌ها تعيين و روابط فيلوژنتيكي بين اين پروتئين‌ها مد نظر قرار گرفت. نتايج نشان داد كه طول 13 توالي نوكلئوتيدي دهيدرين جو از 2117-720 نوكلئوتيد متغيير بود. اكثر اين ژن ها بر روي كروموزوم شماره 6 قرار داشتند. با توجه به مقدار آمينواسيدها، بيشترين فرواني اسيد آمينه در تمامي اين توالي ها مربوط به گليسين با ميانگين مقدار 44/24 درصد بود. بيشترين محل حضور ژن دهيدرين درون هسته، سيتوپلاسم و اندامك هايي مثل كلروپلاست و ميتوكندري است. در تمامي اين توالي ها سه موتيف اصلي K (ليزين)، S (سرين) و Y (تيروزين) شناسايي شد. همچنين بررسي درخت فيلوژنتيكي نشان داد توالي XP-044954513.1 با فاصله بيشتر نسبت به ديگران و بدون زير شاخه و به تنهايي در يك گروه قرارگرفته است. در اين مطالعه پروتئين دهيدرين با شماره هاي دستيابي XP-044980250 با مقدار 89/6- پايدارترين و توالي پروتئين باشماره دستيابي XP-044952547 و مقدار 7/55 ناپايدارترين پروتئين بودند. بالا بودن ضريب خاموشي در تمام توالي ها نشاندهنده طول عمر بالا پروتئين هاست.