بررسي miRNA ها وشناسايي ژن هاي هدف آنها در انگور

La(miRNA) MicroRNA یكی از انواع RNA هایكوچكدرون زاد غیر كد كننده پروتئین می باشند كه در تنظیم فرآیندهای گوناگون سلولی نقش دارند. همچنین تحقیقات نشان داده كه miRNAها نقش مهمی در پاسخ به تنش هایزیستیو غیرزیستی ایفا می كنند. شناسایی miRNAها در گونه های مختلف در سال های اخیر بسیار مورد توجه قرار گرفته است. در این تحقیق miRNAهای گیاه انگور، به منظور بررسی خصوصیات ساختار ساقه - حلقه، توالیوژنهای هدف آنها با استفاده از روش های بیوانفورماتیكی مورد بررسی قرار گرفتند. همچنین مقایسه ای بین miRNAهای انگور با سایر گیاهان به منظور شناسایی miRNAهای حفاظت شده و اختصاصی انجام شد. بررسی پراكنش miRNAها در ژنومنشان از تجمع ژنهای آنها در سه كروموزومیك، یازده وهفده داشت. همچنین فراوان ترین نوكلئوتید در انتهای ۵ مولكول miRNA با طول ۲۰، ۲۱ و ۲۲ اوراسیلو برای طول ۲۴ آدنین بود. در این مطالعه ۱۶ miRNA اختصاصی انگور شناسایی شد. در مجموع برای miRNA های انگور 1099 ژن هدف شناسایی شد كه عمده ترین آنها فاكتورهای رونویسی بودند.

MicroRNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and post-transcriptional silencing mechanisms in plants. Current studies have demonstrated that miRNAs act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. The grapevine miRNAs were surveyed to investigate the features of the stem-loop structures, sequences and target genes using bioinformatics methods. Identification of conserved miRNAs and their targets was performed by comparison between grapevine and every known plant miRNAs. The results showed that, majority of grapevine miRNA have gathered in Chromosomes number 1,11 and 17. The most frequent nucleotide at the 5` terminus of miRNA of the length of 20,21 and 22 nucleotides was found to be uracil and adenine in the case of 24 nucleotide miRNA. All miRNA target genes were identified and among them the most important ones were transcription factors.