بررسي طيف آنتي بيوگرام و ژن هاي مرتبط با بيماري زايي دو سويه انتروكوكوس فاسيوم جداسازي شده از شيره ي درخت بلوط (Quercus brantii var. persica)

Antibiogram Analysis and Detection of Pathogenicity Genes in Two Strains of Enterococcus faecium Isolates from Oak Sap (Quercus brantii var. Persica

باكتري هاي اسيدلاكتيك نقش مهمي در زندگي انسان و ساير موجودات زنده بازي مي كنند. برخي از آن ها مانع از فعاليت ميكروارگانيسم هاي غيرمفيد و بيماري زا مي شوند. باكتري هاي انتروكوكوس، گرم مثبت، كاتالاز منفي، كوكسي شكل، غير اسپورزا و بي هوازي اختياري هستند. هدف از اين مطالعه، جداسازي و شناسايي باكتري هاي پروبيوتيك از شيره درخت بلوط (quercus brantii var. persica) به منظور معرفي باكتري هاي مفيد جهت كاربرد در مبارزه بيولوژيك و به عنوان باكتري هاي صنعتي بود.مواد و روش ها: باكتري هاي اسيدلاكتيك موجود در شيره ي گياه با روش هاي متداول كشت، خواص بيوشيميايي و توالي يابي srrna16 شناسايي شدند. الگوي مقاومت اين سويه ها نسبت به برخي از آنتي بيوتيك ها و همچنين وجود ژن هاي بيماري زايي efaa(آنتي ژن اندوكارديتيس)، as ، ace ، esp و gele به كمك روش pcr مورد بررسي قرار گرفت.يافته ها: نتايج اين مطالعه نشان داد كه از بين 285 كلني اوليه، تعداد 160 كلني (56/1درصد) كاتالاز منفي و گرم مثبت بودند. نتايج توالي يابي s rrna16 نشان داد كه باكتري هاي جداسازي شده به گونه ي انتروكوكوس فاسيوم تعلق دارند. سويه هاي انتروكوكوس فاسيوم با الگوهاي متفاوتي نسبت به آنتي بيوتيك هاي ونكومايسين، آمپي سيلين، سيپروفلوكساسين و نيتروفورانتوئين حساس بودند. دو سويه باكتري انتروكوكوس فاسيوم يكي با توانايي توليد گاز co2 از گلوكز (kx185054) و ديگري ناتوان در توليد گازco2 (kx185055) شناسايي و توالي آن ها در پايگاه ncbi ثبت گرديد. در آزمون شناسايي ژن هاي عامل بيماري زايي، هر دو سويه تنها داراي ژن efaa (آنتي ژن اندوكارديتيس) بودند.استنتاج: در نتيجه اين مطالعه، دو سويه انتروكوكوس فاسيوم از بلوط جداسازي شدند كه مي توانند كانديد مناسبي براي بررسي هاي بيشتر به عنوان پروبيوتيك و كنترل بيولوژيكي باشند.

Background and purpose: Lactic acid bacteria (LAB) play an important role in human and other organisms life. Some of LABs kill pathogenic and other harmful microorganisms. Enterococcus are, gram-positive, catalase-negative, cocci forming, non-sporogenesis, and facultative anaerobic bacteria. This study was done to identify and isolate possible probiotic bacteria with benefits to human health from Persian oak sap (Quercus brantii var. persica). The aim was to identify beneficial bacteria for plant pathogenic biological control and industrial applications. Materials and methods: LABs were identified using conventional methods, including culture dependent methods and 16S rRNA sequencing method. Antibiogram analysis was performed and the presence of virulence genes, including efaA (endocarditis antigen), as, ace, esp and gelE was examined by PCR. Results: It was found that out of 285 colonies, 160 (56.1%) were catalase-negative and grampositive. Results of 16S rRNA sequencing showed that the bacteria isolated bacteria belong to the Enterococcus Faecium species. E. faecium strains of this study were sensitive to a number of clinically important antibiotics such as vancomycin, ampicillin, ciprofloxacin, and nitrofurantoin. Two strains of E. faecium bacteria, one with the ability to produce Co2 from glucose (KX185054) and one with no Co2 production ability (KX185055) were identified. The 16S rRNA sequence of identified strains were deposited in NCBI database. PCR amplification did not amplify virulence genes except efaA (endocarditis antigen). Conclusion: In this study, two different E. faecium strains were isolated from the oak which can be good candidates for probiotics and biological control.