بررسي فيلوژنتيك باكتري‌هاي نمك دوست نسبي و تحمل‌كننده نمك قابل‌كشت در گل‌فشان گميشان

Phylogenetic analysis study of Cultivable moderately halophit and halotolerant bacteria in Gomishan mud volcano

گل‌فشان گميشان در 7 كيلومتري شهرستان گميشان واقع‌شده است. نمونه‌برداري جهت انجام آزمايش در مرداد ماه سال 1392 از اين گل‌فشان انجام گرفت. دماي گل در زمان نمونه‌برداري 1± 38 درجه سانتي گراد و pH 1±8 بود. ميزان شوري 34 گرم بر ليتر اندازه‌گيري شد. يون‌هاي سديم و كلر بيشترين ميزان و آهن كمترين ميزان يون‌ها را در تركيب گل به خود اختصاص داده بودند. از محيط كشت مناسب جهت جداسازي باكتري‌هاي نمك دوست نسبي و تحمل‌كننده نمك استفاده شد. تعداد سلول‌هاي به‌دست‌آمده درروش شمارش كلني حدود 106× 3-1 سلول در هر ميلي‌ليتر بود. 122 سويه خالص‌سازي شدند و از ميان اين تعداد، 42 سويه بر اساس صفات مورفولوژيكي و فيزيولوژيكي اوليه انتخاب و با تكثير و تعيين ترادف ژن S rRNA16 شناسايي شدند. جنس‌هاي Halomonas (20 درصد)، Arthrobacter (5 درصد)، Kocuria (5 درصد)، Thalassobacillus (5 درصد)، Marinobacter (20 درصد)، Paracoccus (5 درصد)، Roseovarius (5 درصد)، Jeotgalicoccus (5 درصد)، Bacillus (15 درصد)، Staphylococcus (15 درصد) جدا شدند. آنزيم‌هاي اكسيداز و كاتالاز در همه سويه ­ها بررسي شدند. 98/4 درصد سويه­ ها كاتالاز مثبت و 7/69 درصد اكسيداز مثبت بودند.

Gomishan mud volcano is located 7 km from Gomishan city and sampling from this mud volcano was performed in August 2013. The temperature of mud was about 38 ± 1 °C with a pH of 8 ± 1. The measured salinity was 34 g/L. Sodium and chloride were the highest and iron was the lowest ions of the mud. The culture medium for the isolation of moderately halophilic and halotolerant bacteria was used. High viable counts (1 – 3 × 106) were obtained in culture media. A total of 122 isolates were obtained 42 colonies were selected based on primarily morphological and physiological traits and their 16S rRNA sequences were determined. The isolated genera included Halomonas (20%), Arthrobacter (5%), Kocuria (5%), Thalassobacillus (5%), Marinobacter (20%), Paracoccus (5%), Roseovarius (5%), Jeotgalicoccus (5%), Bacillus (15%), and Staphylococcus (15%). Oxidase and catalase enzymes were studied in all isolates and 98.4% of isolates were positive catalase and 69.7% were positive oxidase.