گونه هاي شديد و خفيف ويروس پيچيدگي برگ گوجه فرنگي مورد هدف miRNA هاي متفاوتي از ميزبان قرار مي گيرند

Various Tomato microRNAs could target a Mild and a Severe Strain of Tomato Leaf Curl Virus

جميني ويروس ها يكي از مهمترين عوامل محدود كننده كشت گوجه فرنگي در سراسر جهان محسوب ميشوند. ويروس پيچيدگي برگ گوجه فرنگيTomato leaf curl virus (ToLCV) يكي از اعضاي خانواده جميني ويريده مي باشد كه داراي گونه هاي با بيماريزايي شديد و خفيف است. مشخص شده است كه برخي از miRNAهاي ميزبان قادرند ويروس هاي حيواني را هدف قرار داده و مانع از استقرار آنها شوند. تاكنون هيچ گزارشي مبتني بر روش هاي آزمايشگاهي، در مورد ويروس هاي گياهي ارايه نشده است. با اين وجود براساس تحليل هاي بيوانفورماتيكي، ويروس هاي گياهي نيز مي توانند به وسيله miRNAهاي ميزبان هدف قرار گيرند. در اين تحقيق، با استفاده از روش هاي بيوانفورماتيكي امكان اتصال miRNAهاي هاي مختلف ميزبان به گونه هاي شديد و خفيف ToLCV بررسي شده است. نتايج نشان داد miR156 امكان اتصال به هر دو گونه ToLCV را دارد. گونه خفيف ويروس، مورد هدف miR396 ،miR168 ،miR157، miR166 قرار مي گيرد درحالي كه گونه شديد، ToLCV-Au، توسط گروه ديگري از miRNAها شامل miR159 و miR319 و miR403 هدف قرار مي گيرد. تمام miRNAها بجز miR156a با نواحي كد كننده ژنوم ويروس ها جفت مي شوند. در مورد ويروس ToLCV-Au و miRNA319c به ژن V1 متصل مي شود. miR159c و miR403 به ترتيب ژن هاي C1 و C3 متصل مي شوند. ژن C1 گونه ToLCV-Ir، توسط miR157a و miR156h ژن V2 آن نيز در محل هاي مختلف مورد هدف miRNAها شامل miR168b و miR396b و miR166i قرار مي گيرد. نقش احتمالي miRNAهاي به دست آمده در توليد علايم شديد و خفيف توسط هر دو گونه بحث شده است.