شناسايي مولكولي سه گونۀ ويروس در مزارع گوجه فرنگي استان آذربايجان شرقي

آلودگي به ويروس هاي شايع مزارع گوجه فرنگي شامل Cucumber mosaic virus (CMV)،Tomato spotted wilt virus (TSWV) ،Tomato mosaic virus (ToMV)  و Tobacco mosaic virus (TMV) در آذربايجان شرقي مورد بررسي قرار گرفت. تعداد 205 نمونه داراي علائم موزاييك، كوتولگي، نكروز، باريك شدن، بدشكلي برگ ها و ميوه ها جمع آوري و از نظر بررسي علائم، مورد مطالعات گلخانه اي قرار گرفتند. سپس آزمون الايزا براي رديابي  CMV روي نمونه هاي مشكوك به آلودگي با اين ويروس انجام پذيرفت. پس از استخراج RNA كل از نمونه هاي آلوده، RTPCR با آغازگرهاي اختصاصي CMV، آغازگرهاي عمومي جنس توسپوويروس يا توباموويروس با توجه به علايم ويروسي انجام شد. با بهينه سازي PCR از نظر دماي اتصال، قطعات تكثير يافته ي مورد انتظار در تعداد 6، 37 و 23 نمونه به ترتيب با آغازگرهاي توسپوويروس، توباموويروس يا CMV حاصل شد. پروفيل برش آنزيمي با HindIII ، EcoRI و XbaI روي قطعات تكثير يافته با آغازگرهاي توسپوويروس از تعداد شش نمونه نشان داد كه هويت ويروس در همه ي آنها TSWV بود. همسانه سازي و تعيين توالي اين قطعات نيز ماهيت TSWV بودن جدايه ها را تاييد نمود. قطعات DNA تكثير يافته با آغازگرهاي توباموويروس با TaqI برش داده شدند كه طبق پروفيل برشي، آلودگي به ToMV در 37 نمونه محرز شد در حالي كه TMV در هيچيك از نمونه ها پيدا نشد. برش محصول PCR حاصل از آغازگرهاي CMV با آنزيم MspI هم نشان داد كه جدايه هاي CMV متعلق به زير گروه I اين ويروس بودند. همچنين، نتايج گوياي فراواني بيشتر آلودگي با CMV و ToMV در نمونه ها بود.