عنوان مقاله :
ارزيابي الگوهاي بيان ژن مشتق از ريزآرايه در مدلهاي موشي تراژن بيماري آلزايمر (تائو و آميلوئيد بتا) با استفاده از ابزارهاي زيست دادهورزي
پديد آورندگان :
اميني ، جواد دانشگاه زابل - دانشكده علوم پايه - گروه زيست شناسي , سنچولي ، ناصر دانشگاه زابل - دانشكده علوم پايه - گروه زيست شناسي , سندگل ، نيما دانشگاه زابل - دانشكده علوم پايه - گروه زيست شناسي
كليدواژه :
ريزآرايه , زيست داده ورزي , آلزايمر , تائو , آميلوئيد بتا
چكيده فارسي :
هدف: در اين پژوهش تغييرات بيان ژن و تاثير آن بر شبكه هاي پروتئيني، عوامل رونويسي، مسيرهاي سلولي و RNAهاي كوچك در مدلهاي موشي تراژن بيماري آلزايمر (آميلوئيد بتا و تائو) بررسي شد.مواد و روشها: نتايج داده هاي ريز آرايه ژنهاي بافت مغز در پايگاه داده GEO تجزيه و تحليل، پيش بيني شبكهها بهكمك پايگاه داده String انجام و توسط نرم افزار Cytoscape آناليز شد. پيش بيني فاكتورهاي رونويسي و مسيرهاي سلولي ژن ها در سرويس تحت وب Enrichr انجام گرفت. همچنين از درواره ToppGene براي شناسايي نقش RNAهاي كوچك دخيل در اين مدل ها استفاده شد.نتايج: تجزيه و تحليل شبكه هاي پروتئيني نشان داد ژن CTSS (كد كننده پروتئين كاتپسين اس) كه يك سيستئين پروتئاز ليزوزومي است در هر دو مدل ژن كليدي و رابط شبكهاي ميباشد. ژنهاي IRF8 (كد كننده پروتئين عامل 8 تنظيم كننده اينترفرون) و NFE2L2 (كد كننده پروتئين عامل 2 مرتبط با عامل هستهاي اريتروئيدي 2) كه بهترتيب ژن هاي دخيل در سيستم ايمني و استرس اكسيداتيو هستند، بهعنوان عوامل رونويسي تاثيرگذار تعيين شدند. بهعلاوه مشخص شد RNA كوچك let-7 (دخيل در سيستم ايمني) ميتواند بهعنوان تنظيم كننده مهم بيان ژنها در مسيرهاي ژني هر دو مدل بيماري عمل نمايد.نتيجهگيري: سيستم ايمني نقش بسيار مهمي در روند بيماري آلزايمر در هر دو مدل داشته و احتمالا كاهش فعاليت ژنهاي اين سيستم (IRF8 و let-7) بههمراه افزايش ژنهاي دخيل در كاهش استرس اكسيداتيو (CTSS و NFE2L2) در هر دو مدل يك هدف درماني مناسب خواهد بود.
عنوان نشريه :
سلول و بافت
عنوان نشريه :
سلول و بافت