ارزيابي روش مناسب استخراج DNA كپك Aspergillus niger از رب گوجه فرنگي

در اين تحقيق روش هاي استخراج DNA آسپرژيلوس نايجر از رب گوجه فرنگي بهينه سازي شده و با همديگر مقايسه شده اند. به اين منظور از روش هاي كلاسيك استخراج بهينه سازي شده و روش هاي مبتني بر كيت تجاري استفاده شد. اسپور كپك آسپرژيلوس نايجر در غلظت هاي مختلف (101، 103، 105 CFU/gr) به رب گوجه فرنگي اضافه شد و پس از رشد و ايجاد ميسيلوم كپك استخراج DNA با پنج روش انجام شد.تفاوت روش هاي به كار گرفته شده بر اساس استفاده از نيتروژن مايع، اولتراسوند و محلول هاي ليز كننده ديواره سلولي بود. اين روش ها از نقطه نظر كميت و كيفيت DNA استخراج شده با استفاده از روش اسپكتروفتومتري با دستگاه نانودراپ مورد بررسي قرار گرفتند. همچنين با استفاده از الكتروفورز ژل DNA استخراج شده از لحاظ عدم مشاهده هاله و نبود آلودگي پروتئيني و جهت بررسي وجود ممانعت كننده هاي PCR در نمونه هاي DNA استخراج شده عمليات PCR با استفاده از پرايمرهاي پيشرونده و پس رونده طراحي شده انجام شد. نتايج نانودراپ و الكتروفورز ژل DNA و نتايج PCR در 5 روش مويد اين مطلب است كه روش 1 مناسب ترين روش براي استخراج DNA اين كپك از رب گوجه فرنگي مي باشد.